RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 COX8CQ7Z4L0 72 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 SERP2Q8N6R1 65 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 Q96M85 177 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 CALYQ9NYX4 217 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 SLC25A20O43772 301 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM17BO60830 172 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.46□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.46□□□□□ -1.863e-10■■■□□ 16.7
RABGGTB-213ENST00000496055 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 UPK2O00526 184 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 FSHBP01225 129 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 CA6P23280 308 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 DYNLT3P51808 116 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2D3P61077 147 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2D2P62837 147 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 BRD3OSQ6XYD6 125 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 M0R378 163 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 DAD1P61803 113 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM222AQ5U5X8 452 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 PRR14LQ5THK1 2151 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 M0R1W7 72 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 CST7O76096 145 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 NPYP01303 97 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 GNB1P62873 340 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 FHL2Q14192 279 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6P435 159 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 C5orf38Q86SI9 138 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM3DQ96BQ1 224 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 METTL26Q96S19 204 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 IL36RNQ9UBH0 155 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.45□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LCE2CQ5TA81 110 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 COPS9Q8WXC6 57 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM243Q9BU79 118 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 Q9H3A6 140 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 ZFAND3Q9H8U3 227 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 ESM1Q9NQ30 184 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LTAP01374 205 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf1Q9H5F2 150 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 C11orf94C9JXX5 98 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 PPYP01298 95 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNJ2BPP57105 145 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 V9GYV3 84 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC01619G3V211 115 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.44□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC01600Q96MT4 127 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TIMM17AQ99595 171 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL13Q99616 98 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 X6R8D5 127 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 H3BMM0 161 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 IGHV4-59P01825 116 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 DEFB121Q5J5C9 76 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 Q8N2B8 174 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 UBE2WQ96B02 151 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TRGV9Q99603 122 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 SERF2P84101 59 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 Q6ZR03 302 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM223AQ8IWN6 122 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 LINC01006Q8NI28 216 aa3.43□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 TACC2O95359 2948 aa3.42□□□□□ -1.86
RABGGTB-213ENST00000496055 A8MUN3 132 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.7 ms