RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 UFSP1Q6NVU6 142 aa14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 Q6ZSN1 163 aa14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.73□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 K7EN84 100 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 SIVA1O15304 175 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 CRYGDP07320 174 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF727A8MUV8 499 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 LINC00336Q6ZUF6 198 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-202ENST00000460308 SMIM17P0DL12 118 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 PEA15Q15121 130 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PPQ1 181 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 GAGE12JA6NER3 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 F2Z2F3 143 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 IGLC6P0CF74 106 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 CACNG7P62955 275 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 GAGE1Q13065 139 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 GAGE4Q13068 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 GAGE5Q13069 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 GAGE13Q4V321 117 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 TIRAPP58753 221 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 RTL8CO15255 209 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 ERVFC1-1P60608 527 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 RAB4BP61018 213 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF56Q15929 161 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 C6orf223Q8N319 242 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 AP1S3Q96PC3 154 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 F5H697 171 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 RAB14P61106 215 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 LYZL1Q6UWQ5 148 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.65□□□□□ -0.06
ABCD4-202ENST00000460308 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 LINC01551Q86U37 167 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.64□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 EVI2AP22794 236 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 Q9UF83 564 aa14.63□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 A8MWL6 223 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 TRGC1P0CF51 173 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 LELP1Q5T871 98 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 WDR73Q6P4I2 378 aa14.62□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 C9JQL5 133 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 LINC00694P0DN24 101 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 NTF3P20783 257 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 CTRLP40313 264 aa14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 MGPP08493 103 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 TWIST1Q15672 202 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 DNAH2Q9P225 4427 aa14.6□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 K7EP13 123 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 CT83Q5H943 113 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 OSTCQ9NRP0 149 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 NAT8Q9UHE5 227 aa14.59□□□□□ -0.07
ABCD4-202ENST00000460308 A0A087WWC5 75 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 GTSF1Q8WW33 167 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.58□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 LINC00315P59091 139 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 ADIRFQ15847 76 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 BORCS7Q96B45 105 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 CNFNQ9BYD5 112 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.57□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 H7C1H1 209 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.56□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 UBE2D3P61077 147 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 UBE2D2P62837 147 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 TSKUQ8WUA8 353 aa14.55□□□□□ -0.08
ABCD4-202ENST00000460308 ISOC2Q96AB3 205 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms