RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 TAS2R19P59542 299 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 PPP2R5EQ16537 467 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 NAA35Q5VZE5 725 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 PDPNQ86YL7 162 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF738Q8NE65 137 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC26Q8TAB7 109 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 STAG3L4Q8TBR4 150 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 LGALS14Q8TCE9 139 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 SNF8Q96H20 258 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CCL13Q99616 98 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 MGLLQ99685 303 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CNPY3Q9BT09 278 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM43Q9BTV4 400 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 NUF2Q9BZD4 464 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CNIH4Q9P003 139 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 COPZ2Q9P299 210 aa-3□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 MGAT4AQ9UM21 535 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CEP83Q9Y592 693 aa-3□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 A0A1B0GU69 56 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 C7orf71A4D174 169 aa-3.01□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 PSMD9O00233 223 aa-3.01□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 TAX1BP3O14907 124 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 DDAH1O94760 285 aa-3.01□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 CST4P01036 141 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 IL1RNP18510 177 aa-3.01□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 TNFSF4P23510 183 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CDK2P24941 298 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 GSTM5P46439 218 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CASP4P49662 377 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 RAB28P51157 221 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 GPX6P59796 221 aa-3.01□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HERVK_113P63121 156 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 SEC11AP67812 179 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HBG1P69891 147 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HBG2P69892 147 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 TSNQ15631 228 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 RAB11BQ15907 218 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 LTC4SQ16873 150 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 ARL9Q6T311 187 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa-3.01□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 CXorf40AQ8TE69 158 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 SFT2D1Q8WV19 159 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HAUS1Q96CS2 278 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC77Q9BR77 488 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 IFT27Q9BW83 186 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 GSDMCQ9BYG8 508 aa-3.01□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 ARMC1Q9NVT9 282 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HAUS2Q9NVX0 235 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM51Q9NW97 253 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 COMMD3Q9UBI1 195 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 ANXA10Q9UJ72 324 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 C3orf18Q9UK00 162 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP-3.01□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 A0A0B4J2E0 115 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-3.02□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HIGD1CA8MV81 97 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 COPEO14579 308 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CRCPO75575 148 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 UTS2O95399 124 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 METTL18O95568 372 aa-3.02□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 GNA11P29992 359 aa-3.02□□□□□ -2.89
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SNORD54-201ENST00000459159 RANBP1P43487 201 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 MARCKSL1P49006 195 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 CKS1BP61024 79 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 HPCAP84074 193 aa-3.02□□□□□ -2.89
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-3.02□□□□□ -2.89
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