RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	RASL10A	Q92737	203 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q9H8V8	135 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.25	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GV50	99 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		A8MWV9	139 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		B4DEV8	164 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		K7EP13	123 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	GNRH2	O43555	120 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	EVI2A	P22794	236 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	SIVA1	O15304	175 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	PAGE4	O60829	102 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	TYMS	P04818	313 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	CRYBA4	P53673	196 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	RHOH	Q15669	191 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q86TA4	180 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.23	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A096LPF7	62 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550		G3V3Q6	166 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	PDE6D	O43924	150 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	C1QB	P02746	253 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	PTH2	Q96A98	100 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	MUC4	Q99102	2169 aa		4.21	□□□□□ -1.73
SH3BGR-208	ENST00000452550	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		M0R036	132 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	NXPH4	O95158	308 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	GAGE1	Q13065	139 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	GAGE4	Q13068	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ESRG	Q1W209	222 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.21	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A087WWC5	75 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		H3BVH4	76 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		K7EQD1	137 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	RS1	O15537	224 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SH2D1A	O60880	128 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	LTA	P01374	205 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	GNG4	P50150	75 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SULT1A2	P50226	295 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.2	□□□□□ -1.74
SH3BGR-208	ENST00000452550		Q6ZQT7	251 aa		4.2	□□□□□ -1.74

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