RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000451997.5

SH3BP1-203, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 3,123 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-203ENST00000451997 ASIPP42127 132 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 UBE2D3P61077 147 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 UBE2D2P62837 147 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 A6NJY4 79 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 SAA4P35542 130 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TEN1Q86WV5 123 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TRAV2A0A0B4J234 112 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 A8MWV9 139 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 IGHV4-39P01824 125 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 A4D1N5 150 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 B5MCH6 92 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 CRLF1O75462 422 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 IGHV3-30P01768 117 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 AJUBAQ96IF1 538 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 LINC00477Q96M19 166 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 M0R1W7 72 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 NPC2P61916 151 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 OR10J6PQ8NGY7 276 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 NOTCH3Q9UM47 2321 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 ZNF688P0C7X2 276 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 Q6ZSV7 163 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 IGIPA6NJ69 53 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 Q1RN00 199 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 BRD3OSQ6XYD6 125 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 A0A1W2PPR1 153 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 SLC25A20O43772 301 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 EBI3Q14213 229 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 LY6EQ16553 131 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 NACAE9PAV3 2078 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 J3QQQ9 107 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 LINC00315P59091 139 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 PMVKQ15126 192 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 LINC01619G3V211 115 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP1-203ENST00000451997 IGSF10Q6WRI0 2623 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 ERG28Q9UKR5 140 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 K7ENP7 123 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 U3KQE9 123 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 CFAP46Q8IYW2 2715 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 C2CD3Q4AC94 2353 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 A8MZ25 164 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 PRSS2P07478 247 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 HERVK_113P61574 105 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 AMELXQ99217 191 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 SIRPDQ9H106 197 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 TEX29Q8N6K0 151 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 NOTCH2Q04721 2471 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 A0A0J9YXV3 536 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 HTN1P15515 57 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 C3orf56Q8N813 242 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 MDFICQ9P1T7 246 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa9.44□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 PRM2P04554 102 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 SPXQ9BT56 116 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 C9orf139Q6ZV77 190 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 IGHV3-33P01772 117 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 KLK9Q9UKQ9 250 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 CCDC179H3BU77 68 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-203ENST00000451997 ZNF56Q15929 161 aa9.42□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 152 ms