RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 OR5AL1P0C617 328 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 BIN3Q9NQY0 253 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 Q9UF83 564 aa14.39□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE12JA6NER3 117 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 SSTP61278 116 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TNP2Q05952 138 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE1Q13065 139 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE4Q13068 117 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE5Q13069 117 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE13Q4V321 117 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.38□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GZMBP10144 247 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM250H0YL14 139 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 P01737 135 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 OCC1Q8TAD7 63 aa14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 EVI2AP22794 236 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 NUDT11Q96G61 164 aa14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 XKRY2A2RUG3 117 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00315P59091 139 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TOR2AQ5JU69 321 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 LELP1Q5T871 98 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TPPP3Q9BW30 176 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.34□□□□□ -0.11
SH3BP4-204ENST00000416021 PKD1P98161 4303 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 K7EP13 123 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 IGLC6P0CF74 106 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00694P0DN24 101 aa14.33□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 K7EN84 100 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 CEBPGP53567 150 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB4BP61018 213 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM210AQ96ND0 272 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 F2Z2F3 143 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX261Q6UWH6 196 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM17P0DL12 118 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNG7P62955 275 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF56Q15929 161 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01556Q5JQF7 62 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 F5H697 171 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 LYZL1Q6UWQ5 148 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 NFE4Q86UQ8 179 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 C10orf126Q8N4M7 172 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WWC5 75 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 AP1S3Q96PC3 154 aa14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-30P01768 117 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-33P01772 117 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 NTF3P20783 257 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2D3P61077 147 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2D2P62837 147 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR73Q6P4I2 378 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM7Q9BQ49 75 aa14.25□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 PKHD1P08F94 4074 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF727A8MUV8 499 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM231DQ6ZW35 169 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVFC1-1P60608 527 aa14.22□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 MGPP08493 103 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 TRGC1P0CF51 173 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 CTRLP40313 264 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 TWIST1Q15672 202 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC01551Q86U37 167 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 GTSF1Q8WW33 167 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-204ENST00000416021 PEA15Q15121 130 aa14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8N3U1 123 aa14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 A8MWL6 223 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 C9JQL5 133 aa14.19□□□□□ -0.14
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