RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MUC21A0A140T8X8 626 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF727A8MUV8 499 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGLC6P0CF74 106 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDT11Q96G61 164 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LY96Q9Y6Y9 160 aa11.95□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRYGDP07320 174 aa11.94□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PEA15Q15121 130 aa11.94□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTC32Q5I0X7 151 aa11.94□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q6ZSN1 163 aa11.94□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1W2PPQ1 181 aa11.93□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SSTP61278 116 aa11.93□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.93□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AP1S3Q96PC3 154 aa11.93□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F2Z2F3 143 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SIVA1O15304 175 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMIM17P0DL12 118 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TIRAPP58753 221 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB14P61106 215 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CACNG7P62955 275 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF56Q15929 161 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM231DQ6ZW35 169 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC01551Q86U37 167 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.92□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NACAE9PAV3 2078 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAGE12JA6NER3 117 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVFC1-1P60608 527 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAGE1Q13065 139 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAGE4Q13068 117 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAGE5Q13069 117 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GAGE13Q4V321 117 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM74A3Q4VXF1 159 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.91□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GATCO43716 136 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTRLP40313 264 aa11.9□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAB4BP61018 213 aa11.9□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.9□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.9□□□□□ -0.5
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.89□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC00694P0DN24 101 aa11.89□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.89□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C9JQL5 133 aa11.88□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 F5H697 171 aa11.88□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RTL8CO15255 209 aa11.88□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.88□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CT83Q5H943 113 aa11.88□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.88□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C6orf223Q8N319 242 aa11.88□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCLOQ9Y6V0 5065 aa11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A8MWL6 223 aa11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRGC1P0CF51 173 aa11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR73Q6P4I2 378 aa11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.87□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LELP1Q5T871 98 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GTSF1Q8WW33 167 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNFNQ9BYD5 112 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q9UF83 564 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NAT8Q9UHE5 227 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.86□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa11.85□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRSS29PA6NIE9 313 aa11.85□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MGPP08493 103 aa11.85□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NTF3P20783 257 aa11.85□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OSTCQ9NRP0 149 aa11.85□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 K7EP13 123 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EVI2AP22794 236 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPL23P62829 140 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TWIST1Q15672 202 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADIRFQ15847 76 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ISOC2Q96AB3 205 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.84□□□□□ -0.51
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A087WWC5 75 aa11.83□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LINC00315P59091 139 aa11.83□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLLU1Q5K131 121 aa11.83□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.83□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TSKUQ8WUA8 353 aa11.83□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BORCS7Q96B45 105 aa11.83□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.83□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H7C1H1 209 aa11.82□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE2D3P61077 147 aa11.82□□□□□ -0.52
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE2D2P62837 147 aa11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms