RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 EDN2P20800 178 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 LEPP41159 167 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ERCC8Q13216 396 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 SLAQ13239 276 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 DNLZQ5SXM8 178 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 KCNS1Q96KK3 526 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 OR4C46A6NHA9 309 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 IFITM10A6NMD0 228 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 F2Z2F3 143 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 SNAI2O43623 268 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CSN3P07498 182 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 GZMBP10144 247 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CD28P10747 220 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TSPOP30536 169 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 SRIP30626 198 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CAMPP49913 170 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PSMG4Q5JS54 123 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TMEM18Q96B42 140 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.81□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 A0A0J9YX75 114 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 GRIFINA4D1Z8 144 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 A8MTW9 85 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CCL24O00175 119 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ORM1P02763 201 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 OR5AL1P0C617 328 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ZNF688P0C7X2 276 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CACNG7P62955 275 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PRR9Q5T870 116 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 NDUFA11Q86Y39 141 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TPPP3Q9BW30 176 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.8□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PKHD1P08F94 4074 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 C7orf71A4D174 169 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 F6UB75 175 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 NXPH4O95158 308 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 AMBPP02760 352 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 GPX1P07203 203 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 HLA-DRB4P13762 266 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 FABP4P15090 132 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ASIPP42127 132 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CDKN1BP46527 198 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TDRG1Q3Y452 100 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 BAGE3Q86Y29 109 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 RCHY1Q96PM5 261 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TMEM191AQ9H0A3 160 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.79□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 SERF1AO75920 110 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 PPBPP02775 128 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 TFPI2P48307 235 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 SMIM15Q7Z3B0 74 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 ORMDL3Q8N138 153 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 DUX3Q96PT4 197 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 C12orf57Q99622 126 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 FAM110AQ9BQ89 295 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 NAGKQ9UJ70 344 aa4.78□□□□□ -1.64
CCL20-202ENST00000409189 H3BVH4 76 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 RAB4AP20338 218 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.77□□□□□ -1.65
CCL20-202ENST00000409189 FAM159AQ6UWV7 190 aa4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms