RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLB1Q6P1J6 1458 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ADGBQ8N7X0 1667 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 WDR97A6NE52 1622 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 H3BMG7 143 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DEGS1O15121 323 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NIPSNAP2O75323 286 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HBDP02042 147 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFNA6P05013 189 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BRK1Q8WUW1 75 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CFAP53Q96M91 514 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BATF3Q9NR55 127 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LAMC1P11047 1609 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFNA21P01568 189 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AKR1D1P51857 326 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GNG3P63215 75 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMED2Q15363 201 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C3orf33Q6P1S2 294 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SLC25A26Q70HW3 274 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NUP35Q8NFH5 326 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR13C6PQ8NH95 151 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CEP19Q96LK0 163 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CBLN4Q9NTU7 201 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TSC2P49815 1807 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 M0R2T5 61 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFNA1P01562 189 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPRR1BP22528 89 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPRR2AP35326 72 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 OR8B8Q15620 311 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM24BQ8N5W8 94 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AP3S1Q92572 193 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TCRAP04437 139 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPRR2EP22531 72 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KDM5CP41229 1560 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EDDM3BP56851 147 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KLK9Q2XQG4 91 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UFC1Q9Y3C8 167 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PKD1P98161 4303 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 I3L2K1 104 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NPFFO15130 113 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HSD11B1P28845 292 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 REEP5Q00765 189 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPCS2Q15005 226 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LRP6O75581 1613 aa-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PARP14Q460N5 1801 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MUC17Q685J3 4493 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NBASA2RRP1 2371 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 STX12Q86Y82 276 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.87□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.7 ms