RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC01587Q99440 93 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.67■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 FXYD7P58549 80 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF415Q09FC8 603 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR3DS1Q14943 382 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA1644Q3SXP7 199 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa16.66■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 GNRH2O43555 120 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 SSTP61278 116 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF124Q15973 351 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 ORMDL3Q8N138 153 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 OR10AG1Q8NH19 301 aa16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R381 172 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 WIPF1O43516 503 aa16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP16.64■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 CRXO43186 299 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 CKS2P33552 79 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF575Q86XF7 245 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 Q8N1Y9 231 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM18Q96B42 140 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.63■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 PPP1R17O96001 155 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 PRR31Q5SQ13 230 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 SPXQ9BT56 116 aa16.62■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 NXPH4O95158 308 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 Q6ZQT7 251 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 MRAP2Q96G30 205 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 C9orf85Q96MD7 179 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 NDUFAF3Q9BU61 184 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 C19orf73Q9NVV2 129 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 XCL2Q9UBD3 114 aa16.61■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 TENM1Q9UKZ4 2725 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 AKR1D1P51857 326 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 AMN1Q8IY45 258 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa16.6■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 HIST3H2BBQ8N257 126 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 PTH2Q96A98 100 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 PRELID3AQ96N28 172 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 U3KQK5 164 aa16.59■□□□□ 0.25
CAPNS1-212ENST00000591041 HTN1P15515 57 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 IGLL1P15814 213 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 APOC4P55056 127 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 C18orf32Q8TCD1 76 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SAMD10Q9BYL1 202 aa16.58■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 ESDP10768 282 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RAB4AP20338 218 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 CSTL1Q9H114 145 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MSRB1Q9NZV6 116 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa16.57■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 D6R8Y8 96 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 PMCHP20382 165 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 DEFB125Q8N687 156 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RCHY1Q96PM5 261 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MGAM2Q2M2H8 2515 aa16.56■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 M0R2P5 195 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 HSBP1O75506 76 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP1LC3AQ9H492 121 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MDFICQ9P1T7 246 aa16.55■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SERF1AO75920 110 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 EVI2AP22794 236 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 FA2HQ7L5A8 372 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa16.54■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 A8MWV9 139 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF876PQ49A33 203 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SORL1Q92673 2214 aa16.53■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 AGRNO00468 2067 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMY1CP0DJD4 496 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 PDZD11Q5EBL8 140 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 C16orf74Q96GX8 76 aa16.52■□□□□ 0.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MGPP08493 103 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 LINC00614P0C842 121 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 FABP4P15090 132 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 RNF185Q96GF1 192 aa16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CAPNS1-212ENST00000591041 RHODO00212 210 aa16.5■□□□□ 0.23
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