RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SH2D1A	O60880	128 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TYMS	P04818	313 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CRIP1	P50238	77 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		Q6AWC8	147 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		Q6ZTI0	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		A0A0J9YY99	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		K7EP13	123 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LTA	P01374	205 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ORM1	P02763	201 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	NMB	P08949	121 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	XG	P55808	180 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LINC00315	P59091	139 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ERVFC1-1	P60608	527 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SST	P61278	116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		Q5VSD8	79 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	NFE4	Q86UQ8	179 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		C9JCJ5	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		C9JQL5	133 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		H3BVH4	76 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SIVA1	O15304	175 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	HOXA5	P20719	270 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	GNG4	P50150	75 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	IFITM2	Q01629	132 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	PARL	Q9H300	379 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		A0A096LPF7	62 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		B4DEV8	164 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	PDE6D	O43924	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SFTA3	P0C7M3	94 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	GZMB	P10144	247 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TCL1A	P56279	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		A0A087WTM6	91 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SLA	Q13239	276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.68	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688		K7EN84	100 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	SPINK4	O60575	86 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	GCSH	P23434	173 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	ASIP	P42127	132 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CS-233	ENST00000552688	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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