RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534401.5

PKP3-211, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 756 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-211ENST00000534401 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
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PKP3-211ENST00000534401 CFAP126Q5VTH2 177 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP3-211ENST00000534401 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.73□□□□□ -0.05
PKP3-211ENST00000534401 DNAH2Q9P225 4427 aa14.73□□□□□ -0.05
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PKP3-211ENST00000534401 ASIPP42127 132 aa14.72□□□□□ -0.05
PKP3-211ENST00000534401 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
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PKP3-211ENST00000534401 RPL35P42766 123 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
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PKP3-211ENST00000534401 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
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PKP3-211ENST00000534401 M0R036 132 aa14.68□□□□□ -0.06
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PKP3-211ENST00000534401 IFNA1P01562 189 aa14.68□□□□□ -0.06
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PKP3-211ENST00000534401 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.68□□□□□ -0.06
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PKP3-211ENST00000534401 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.67□□□□□ -0.06
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PKP3-211ENST00000534401 SLC25A29Q8N8R3 303 aa14.65□□□□□ -0.06
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PKP3-211ENST00000534401 SH2D6Q7Z4S9 175 aa14.63□□□□□ -0.07
PKP3-211ENST00000534401 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.63□□□□□ -0.07
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PKP3-211ENST00000534401 SFRP2Q96HF1 295 aa14.62□□□□□ -0.07
PKP3-211ENST00000534401 MED9Q9NWA0 146 aa14.62□□□□□ -0.07
PKP3-211ENST00000534401 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa14.61□□□□□ -0.07
PKP3-211ENST00000534401 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.61□□□□□ -0.07
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PKP3-211ENST00000534401 C6orf223Q8N319 242 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-211ENST00000534401 PRADC1Q9BSG0 188 aa14.59□□□□□ -0.07
PKP3-211ENST00000534401 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-211ENST00000534401 PRSS29PA6NIE9 313 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-211ENST00000534401 TMEM250H0YL14 139 aa14.58□□□□□ -0.08
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PKP3-211ENST00000534401 PRR27Q6MZM9 219 aa14.58□□□□□ -0.08
PKP3-211ENST00000534401 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.56□□□□□ -0.08
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