RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516032.1

RNU6-1334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1334P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NAP1L6A6NFF2 107 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CGAP01215 116 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMARCA4P51532 1647 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCL8P80075 99 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 Q8N9L7 120 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MGST2Q99735 147 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 REG4Q9BYZ8 158 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DOCK1Q14185 1865 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMCO4Q9NRQ5 59 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRPM7Q96QT4 1865 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADAMTS12P58397 1594 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 HCG22E2RYF7 251 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CTSGP08311 255 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 Q6ZTI0 123 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYO9BQ13459 2157 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SHANK2Q9UPX8 1470 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PDCD5O14737 125 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ADIRFQ15847 76 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CYTL1Q9NRR1 136 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCL26Q9Y258 94 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SCN3AQ9NY46 2000 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DISP1Q96F81 1524 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PCSK5Q92824 1860 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa3.54□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLIN4Q96Q06 1357 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 Q5BKY6 102 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SERP2Q8N6R1 65 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SLIT2O94813 1529 aa3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SHROOM2Q13796 1616 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PDE6HQ13956 83 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGFBP7Q16270 282 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C1orf137Q5JT78 98 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LINC00167Q96N53 147 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ST20Q9HBF5 79 aa3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 DIP2BQ9P265 1576 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYH8P13535 1937 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CCL16O15467 120 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ELOBQ15370 118 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SPINK14Q6IE38 97 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CSAG1Q6PB30 78 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RABAC1Q9UI14 185 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MYO16Q9Y6X6 1858 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PSME4Q14997 1843 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 EML5Q05BV3 1969 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PPLO60437 1756 aa3.51□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PLXNA2O75051 1894 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KIF20BQ96Q89 1820 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 H3BRM9 83 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 AMELYQ99218 206 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRGV9Q99603 122 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MANBALQ9NQG1 85 aa3.5□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 PXDNQ92626 1479 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NLRP1Q9C000 1473 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MPV17LQ2QL34 196 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 C22orf24Q9Y442 160 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ANK1P16157 1881 aa3.49□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MUC4Q99102 2169 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 A0A0G2JQZ4 141 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 RTL8CO15255 209 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 NDUFC1O43677 76 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 MOBPQ13875 183 aa3.48□□□□□ -1.85
RNU6-1334P-201ENST00000516032 ETDBQ3ZM63 59 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 885.6 ms