RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 GAGE12JA6NER3 117 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 EPM2AB3EWF7 344 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 M0R036 132 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 CRIP1P50238 77 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PPT1P50897 306 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 GAGE1Q13065 139 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 GAGE4Q13068 117 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 GAGE5Q13069 117 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 SLAQ13239 276 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 GAGE13Q4V321 117 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 Q5VSD8 79 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 C5orf17Q8NAS9 161 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 SUN5Q8TC36 379 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 MED28Q9H204 178 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.95□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 ORM1P02763 201 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 EVI2AP22794 236 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 FHITP49789 147 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.94□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GV50 99 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 H3BVH4 76 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 SMUG1Q53HV7 270 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PARLQ9H300 379 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.93□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 A0A087WWL8 130 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 FAM74A7A6NL05 159 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 TAAR5O14804 337 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 CXorf1O96002 111 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 GCSHP23434 173 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 Q86TA4 180 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 KCNS1Q96KK3 526 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PEX7O00628 323 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 EREGO14944 169 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PSCAO43653 123 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 SH2D1AO60880 128 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PTTG1O95997 202 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 IFNA7P01567 189 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 GIPP09681 153 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00694P0DN24 101 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 NFE4Q86UQ8 179 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.91□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 HERC1Q15751 4861 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 B4DEV8 164 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 ARPC5O15511 151 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 SSTP61278 116 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 RHOHQ15669 191 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 LELP1Q5T871 98 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 Q8N814 137 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.9□□□□□ -1.46
HDAC3-211ENST00000491581 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1W2PRE2 83 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 M0R381 172 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 ASIPP42127 132 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 SERF2P84101 59 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 ZFP69Q49AA0 526 aa5.89□□□□□ -1.47
HDAC3-211ENST00000491581 CDPF1Q6NVV7 123 aa5.89□□□□□ -1.47
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