RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
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SHQ1-202ENST00000444040 SAMD13Q5VXD3 122 aa11.99□□□□□ -0.49
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SHQ1-202ENST00000444040 TMEM89A2RUT3 159 aa11.98□□□□□ -0.49
SHQ1-202ENST00000444040 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
SHQ1-202ENST00000444040 K7EMI3 77 aa11.98□□□□□ -0.49
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SHQ1-202ENST00000444040 H3BUT2 72 aa11.93□□□□□ -0.5
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SHQ1-202ENST00000444040 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
SHQ1-202ENST00000444040 Q6YL49 198 aa11.91□□□□□ -0.5
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SHQ1-202ENST00000444040 TM2D2Q9BX73 214 aa11.91□□□□□ -0.5
SHQ1-202ENST00000444040 CST9LQ9H4G1 147 aa11.91□□□□□ -0.5
SHQ1-202ENST00000444040 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.9□□□□□ -0.5
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SHQ1-202ENST00000444040 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa11.9□□□□□ -0.5
SHQ1-202ENST00000444040 A0A087WWL8 130 aa11.9□□□□□ -0.5
SHQ1-202ENST00000444040 IGKV3-20P01619 116 aa11.9□□□□□ -0.5
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SHQ1-202ENST00000444040 MYO18BQ8IUG5 2567 aa11.88□□□□□ -0.51
SHQ1-202ENST00000444040 CRYGDP07320 174 aa11.87□□□□□ -0.51
SHQ1-202ENST00000444040 Q8N1Y9 231 aa11.87□□□□□ -0.51
SHQ1-202ENST00000444040 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SHQ1-202ENST00000444040 ACACBO00763 2458 aa11.87□□□□□ -0.51
SHQ1-202ENST00000444040 TSHBP01222 138 aa11.87□□□□□ -0.51
SHQ1-202ENST00000444040 ZFP2Q6ZN57 461 aa11.87□□□□□ -0.51
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