RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.46□□□□□ -1.69
HOXD8-202ENST00000429017 PRELID1Q9Y255 219 aa4.46□□□□□ -1.69
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HOXD8-202ENST00000429017 B4DEV8 164 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM250H0YL14 139 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 H3BNG1 76 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 H3BQ15 152 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 PDE6DO43924 150 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 COX7A2P2O60397 106 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 C20orf144Q9BQM9 153 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.46□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.45□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 STAG3L3P0CL85 134 aa4.45□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM37Q8WXS4 190 aa4.45□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 IGLC2P0DOY2 106 aa4.44□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 S100A7P31151 101 aa4.44□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 HAMPP81172 84 aa4.44□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZQT7 251 aa4.44□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 M0R3E3 92 aa4.43□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 PRR9Q5T870 116 aa4.43□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.43□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 YPEL4Q96NS1 127 aa4.43□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.43□□□□□ -1.7
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HOXD8-202ENST00000429017 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.42□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 PAXXQ9BUH6 204 aa4.42□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.42□□□□□ -1.7
HOXD8-202ENST00000429017 PARLQ9H300 379 aa4.42□□□□□ -1.7
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