RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM75Q8N9X5 138 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 SCGB1D2O95969 90 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TCRBP04435 133 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 STPG4Q8N801 248 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TMED6Q8WW62 240 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 AP3S1Q92572 193 aa7.28□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087WWL8 130 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 CCSO14618 274 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 CST7O76096 145 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 MBPP02686 304 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 PRR34Q9NV39 138 aa7.27□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 IL18Q14116 193 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 TREM1Q9NP99 234 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.26□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 C9orf170A2RU37 121 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 A8MWV9 139 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 RGS5O15539 181 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 UBE2D3P61077 147 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 UBE2D2P62837 147 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 Q6ZRP5 223 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 HYLS1Q96M11 299 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 GSKIPQ9P0R6 139 aa7.25□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 SMIM18P0DKX4 95 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 BAXQ07812 192 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 CTF1Q16619 201 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 DIRAS2Q96HU8 199 aa7.24□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 LINC01559Q495D7 138 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 MCFD2Q8NI22 146 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 SGK494Q96LW2 274 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 AP5S1Q9NUS5 200 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 MUC17Q685J3 4493 aa7.23□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 FGF7P21781 194 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 NMES1Q9C002 83 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 Q9H521 79 aa7.22□□□□□ -1.25
DDX39B-208ENST00000428098 A0A096LNI7 61 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 BCAP31P51572 246 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 RBX1P62877 108 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 CACNG7P62955 275 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 PTTG1O95997 202 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 IFNA7P01567 189 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 RAB5CP51148 216 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.2□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 IGSF23A1L1A6 192 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 L7N2F9 121 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 OR7C2O60412 319 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 GCGP01275 180 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 VAMP2P63027 116 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 GNG5P63218 68 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 C15orf56Q8N910 161 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 OTORQ9NRC9 128 aa7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087WXM4 84 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 S100A11P31949 105 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 REG3AQ06141 175 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 GAGE6Q13070 117 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 TRIM63Q969Q1 353 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.17□□□□□ -1.26
DDX39B-208ENST00000428098 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms