RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 ALPK3Q96L96 1907 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 FAM120AOSQ5T036 256 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 CFHR4Q92496 578 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 C2orf16Q68DN1 1984 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 C2orf70A6NJV1 201 aa5.49□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 SEC16AO15027 2179 aa5.49□□□□□ -1.53
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ALMS1-201ENST00000423048 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.48□□□□□ -1.53
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ALMS1-201ENST00000423048 LYNX1P0DP58 116 aa5.47□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.47□□□□□ -1.53
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ALMS1-201ENST00000423048 LINC00479Q96M42 142 aa5.47□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 U3KQE9 123 aa5.47□□□□□ -1.53
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ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.47□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 COX17Q14061 63 aa5.47□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 COX7B2Q8TF08 81 aa5.47□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa5.47□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.47□□□□□ -1.53
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ALMS1-201ENST00000423048 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.46□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 MLANAQ16655 118 aa5.46□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.46□□□□□ -1.53
ALMS1-201ENST00000423048 GTSF1Q8WW33 167 aa5.46□□□□□ -1.53
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ALMS1-201ENST00000423048 S4R3C0 116 aa5.46□□□□□ -1.53
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ALMS1-201ENST00000423048 BCE1O60756 84 aa5.45□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.45□□□□□ -1.54
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ALMS1-201ENST00000423048 TAX1BP3O14907 124 aa5.45□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 RS1O15537 224 aa5.45□□□□□ -1.54
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ALMS1-201ENST00000423048 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.45□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 DAND5Q8N907 189 aa5.45□□□□□ -1.54
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ALMS1-201ENST00000423048 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.45□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 NCOR1O75376 2440 aa5.45□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 NDUFA1O15239 70 aa5.45□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 Q8NA96 180 aa5.45□□□□□ -1.54
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ALMS1-201ENST00000423048 Q6YL49 198 aa5.44□□□□□ -1.54
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ALMS1-201ENST00000423048 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 TTC28Q96AY4 2481 aa5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087WWL8 130 aa5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 SMKR1H3BMG3 65 aa5.44□□□□□ -1.54
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ALMS1-201ENST00000423048 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.44□□□□□ -1.54
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ALMS1-201ENST00000423048 TCF15Q12870 199 aa5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 PRO0255Q9UI72 69 aa5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 G3V318 75 aa5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 FOXI1Q12951 378 aa5.44□□□□□ -1.54
ALMS1-201ENST00000423048 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.43□□□□□ -1.54
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