RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 AKAP14Q86UN6 197 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 K7EP13 123 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 GNRH2O43555 120 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 SULT1A2P50226 295 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 RAB5CP51148 216 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 XGP55808 180 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 PRNTQ86SH4 94 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 SLC51BQ86UW2 128 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 FMC1Q96HJ9 113 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-204ENST00000403441 A0A087WTM6 91 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 PAGE4O60829 102 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 LTAP01374 205 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 IFNA7P01567 189 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 PPT1P50897 306 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 CRYBA4P53673 196 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 PTH2Q96A98 100 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 C9orf85Q96MD7 179 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 EVI2AP22794 236 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 SRIP30626 198 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 CRIP1P50238 77 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-1P60331 282 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 FHL2Q14192 279 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 ZFP69Q49AA0 526 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 DNLZQ5SXM8 178 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 NAGKQ9UJ70 344 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 M0R2P5 195 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 GCSHP23434 173 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 MLST8Q9BVC4 326 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GVG6 124 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 FAM229AH3BQW9 127 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 ORM1P02763 201 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 CCL20P78556 96 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 CST9LP1Q5W188 147 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 C11orf52Q96A22 123 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 ZNF479Q96JC4 524 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 MANBALQ9NQG1 85 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 K7EQD1 137 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 C9JCJ5 164 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 PSCAO43653 123 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 CRYGDP07320 174 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 GYPEP15421 78 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 AKR1C3P42330 323 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 UBE2G1P62253 170 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 LINC01559Q495D7 138 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-204ENST00000403441 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GV50 99 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 RS1O15537 224 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 CIDEAO60543 219 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 SH2D1AO60880 128 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 SFTA3P0C7M3 94 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZSN1 163 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 IL36BQ9NZH7 164 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 MYCBP2O75592 4640 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 ZNF876PQ49A33 203 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 GNG13Q9P2W3 67 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-204ENST00000403441 TEX46H3BTG2 121 aa8.31□□□□□ -1.08
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