RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 MDFICQ9P1T7 246 aa14.94□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 M0R381 172 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 PRM2P04554 102 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 CNFNQ9BYD5 112 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 MSRB1Q9NZV6 116 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 APCSP02743 223 aa14.93□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 RIPPLY3P57055 190 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.92□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 MUC4Q99102 2169 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.91□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 TRGC1P0CF51 173 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 SLAQ13239 276 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 C9orf85Q96MD7 179 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 APOC4P55056 127 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF415Q09FC8 603 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.9□□□□□ -0.02
ATG4B-204ENST00000402096 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 PHOX2AO14813 284 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.89□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 GATD1Q8NB37 220 aa14.88□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BKO60814 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BJP06899 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 AZU1P20160 251 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BOP23527 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BBP33778 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BDP58876 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BCP62807 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 SYT8Q8NBV8 401 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 RCHY1Q96PM5 261 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.87□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 EVI2AP22794 236 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 AMN1Q8IY45 258 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 ANK2Q01484 3957 aa14.86□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.85□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 NXPH4O95158 308 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 S100A6P06703 90 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 AP1S3Q96PC3 154 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 SRIP30626 198 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 RRN3P1Q2M238 152 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF876PQ49A33 203 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-204ENST00000402096 NDUFA6P56556 154 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 DEFB135Q30KP9 77 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 SPXQ9BT56 116 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 M0R2P5 195 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM17P0DL12 118 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 C16orf74Q96GX8 76 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 UBE2CO00762 179 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 MGPP08493 103 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 RAB4AP20338 218 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 JPT2Q9H910 190 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 RNF185Q96GF1 192 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 A0A087WWL8 130 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 D6R8Y8 96 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 CKS2P33552 79 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 A8MZ25 164 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 SMKR1H3BMG3 65 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 NCR2O95944 276 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-204ENST00000402096 ORMDL3Q8N138 153 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 IL17DQ8TAD2 202 aa14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 EMP1P54849 157 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 PRELID3AQ96N28 172 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 X6R8D5 127 aa14.76□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 SMIM9A6NGZ8 99 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 IQCJQ1A5X6 159 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 BAGE3Q86Y29 109 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 OR11H2Q8NH07 326 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 PTH2Q96A98 100 aa14.75□□□□□ -0.05
ATG4B-204ENST00000402096 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms