RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 F5H768 121 aa16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGHV3-53P01767 116 aa16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 GZMBP10144 247 aa16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 CXCL1P09341 107 aa16.08■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 SFTA3P0C7M3 94 aa16.08■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 NAT8Q9UHE5 227 aa16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.07■□□□□ 0.16
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SIGMAR1-201ENST00000277010 OR10AG1Q8NH19 301 aa16.03■□□□□ 0.16
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
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SIGMAR1-201ENST00000277010 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.02■□□□□ 0.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa16■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 RS1O15537 224 aa16■□□□□ 0.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16■□□□□ 0.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM218A2RU14 115 aa15.98■□□□□ 0.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A1W2PPQ1 181 aa15.97■□□□□ 0.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 A8MWL6 223 aa15.96■□□□□ 0.15
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SIGMAR1-201ENST00000277010 V9GYV3 84 aa15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 F2Z2F3 143 aa15.95■□□□□ 0.14
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SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A087WWL8 130 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 F8W036 122 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CTRLP40313 264 aa15.94■□□□□ 0.14
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SIGMAR1-201ENST00000277010 SLAQ13239 276 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 LYSTQ99698 3801 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PAX4O43316 350 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUDT3O95989 172 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.93■□□□□ 0.14
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SIGMAR1-201ENST00000277010 MSRB1Q9NZV6 116 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CIDEAO60543 219 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CRYGDP07320 174 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CACNG7P62955 275 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFP2Q6ZN57 461 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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