RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277010.8

SIGMAR1-201, Transcript of sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIGMAR1, Length 1,656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1-201ENST00000277010 F5H768 121 aa16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGHV3-53P01767 116 aa16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 GZMBP10144 247 aa16.09■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 CXCL1P09341 107 aa16.08■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 SFTA3P0C7M3 94 aa16.08■□□□□ 0.17
SIGMAR1-201ENST00000277010 NAT8Q9UHE5 227 aa16.08■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 HOXA5P20719 270 aa16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 SCRT2Q9NQ03 307 aa16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa16.07■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 ERVFC1-1P60608 527 aa16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPL23P62829 140 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 COMMD7Q86VX2 200 aa16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 POM121L12Q8N7R1 296 aa16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADIRFQ15847 76 aa16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 DMRTA1Q5VZB9 504 aa16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 PTH2Q96A98 100 aa16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM231DQ6ZW35 169 aa16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZNF479Q96JC4 524 aa16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 MUC4Q99102 2169 aa16.05■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 TENM2Q9NT68 2774 aa16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 XKRY2A2RUG3 117 aa16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 M0R381 172 aa16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 MED14OSP0DP75 135 aa16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 TPPP3Q9BW30 176 aa16.04■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRAV4A0A0B4J268 109 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 MUC21A0A140T8X8 626 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 LINC00862A6NCI5 91 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 GATCO43716 136 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 UQCC3Q6UW78 93 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR4C5Q8NGB2 326 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR10AG1Q8NH19 301 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 ISOC2Q96AB3 205 aa16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 SNAI2O43623 268 aa16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 SYT8Q8NBV8 401 aa16.02■□□□□ 0.16
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR5AL1P0C617 328 aa16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGLC6P0CF74 106 aa16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SSTP61278 116 aa16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CFAP126Q5VTH2 177 aa16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 JPT2Q9H910 190 aa16.02■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFP82Q8N141 532 aa16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NDUFAF3Q9BU61 184 aa16.01■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa16■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 RS1O15537 224 aa16■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 FHL2Q14192 279 aa16■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa16■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM210BQ96KR6 192 aa16■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 OSTCQ9NRP0 149 aa16■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A0J9YY99 117 aa15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SFRP2Q96HF1 295 aa15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 APLNQ9ULZ1 77 aa15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SPANXN1Q5VSR9 72 aa15.99■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TMEM218A2RU14 115 aa15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 A8MWV9 139 aa15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 C15orf54Q8N8G6 183 aa15.98■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A1W2PPQ1 181 aa15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 NXPH4O95158 308 aa15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 CT83Q5H943 113 aa15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 GTSF1Q8WW33 167 aa15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 SAMD10Q9BYL1 202 aa15.97■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 A8MWL6 223 aa15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 ADCYAP1P18509 176 aa15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 TCTAP57738 103 aa15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 PRO0255Q9UI72 69 aa15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 HHLA3Q9XRX5 114 aa15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 V9GYV3 84 aa15.96■□□□□ 0.15
SIGMAR1-201ENST00000277010 F2Z2F3 143 aa15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 VSIG2Q96IQ7 327 aa15.95■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 A0A087WWL8 130 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 F8W036 122 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CTRLP40313 264 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CRYBA4P53673 196 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 SLAQ13239 276 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 FAM74A4Q5TZK3 123 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 LYSTQ99698 3801 aa15.94■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PAX4O43316 350 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 NUDT3O95989 172 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 C15orf53Q8NAA6 179 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 TSKUQ8WUA8 353 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 MSRB1Q9NZV6 116 aa15.93■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CIDEAO60543 219 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CRYGDP07320 174 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 CACNG7P62955 275 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 ZFP2Q6ZN57 461 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 PGLYRP4Q96LB8 373 aa15.92■□□□□ 0.14
SIGMAR1-201ENST00000277010 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169.5 ms