RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	UBE2G2	P60604	165 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	ESRG	Q1W209	222 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	SMUG1	Q53HV7	270 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	RASL10A	Q92737	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A096LPF7	62 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825		M0R2P5	195 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	GCG	P01275	180 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	TYMS	P04818	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF345	Q14585	488 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	C8orf49	Q96NF6	230 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A0D9SG52	128 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	CRYBA4	P53673	196 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	FHL2	Q14192	279 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	C6orf223	Q8N319	242 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	UPK3B	Q9BT76	320 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
EFTUD2-215	ENST00000589825	HMSD	A8MTL9	139 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	PEX7	O00628	323 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGLV2-11	P01706	119 aa		11.13	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825		C9JCJ5	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	PFDN1	O60925	122 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	ORM1	P02763	201 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	SEC11B	P0C7V7	166 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	SRI	P30626	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	UBE2G1	P62253	170 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	LINC00479	Q96M42	142 aa		11.12	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1B0GVY2	172 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	BCL2L11	O43521	198 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		11.11	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1W2PPQ1	181 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	SIVA1	O15304	175 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	GYPE	P15421	78 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.1	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825		K7EQD1	137 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	CIDEA	O60543	219 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	FHIT	P49789	147 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.09	□□□□□ -0.63
EFTUD2-215	ENST00000589825	NXPH4	O95158	308 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825		Q86TA4	180 aa		11.08	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825		A0A1B0GV50	99 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	ASIP	P42127	132 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	AKR1C3	P42330	323 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.07	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	PAGE4	O60829	102 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	TNP2	Q05952	138 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		11.06	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825		B4DEV8	164 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	RS1	O15537	224 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	EIF5AL1	Q6IS14	154 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	PTH2	Q96A98	100 aa		11.05	□□□□□ -0.64
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNAH2	Q9P225	4427 aa		11.04	□□□□□ -0.64

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