RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589626.5

FBXL12-208, Transcript of F-box and leucine rich repeat protein 12, human

TSL 2 BASIC

Gene FBXL12, Length 1,920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXL12-208	ENST00000589626	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626		A6NDN8	102 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	LINC01548	A6NM66	108 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626		K7EP13	123 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	C16orf92	Q96LL3	132 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	CBY3	A6NI87	242 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626		Q8N8P6	123 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	ITPR3	Q14573	2671 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	SNAI2	O43623	268 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	HSD52	Q0P140	79 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	PIFO	Q8TCI5	191 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626		J3QLI3	93 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	TRGV3	P03979	118 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	ARL3	P36405	182 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	SMPX	Q9UHP9	88 aa		12.06	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	C7orf71	A4D174	169 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	ATP5L	O75964	103 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	EVI2A	P22794	236 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM219	Q86XT9	240 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	C18orf15	Q96N68	181 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV1-69	P01742	117 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	CR1	P17927	2039 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	NMU	P48645	174 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	GLMP	Q8WWB7	406 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	AP1S3	Q96PC3	154 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		12.05	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		12.04	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	PRSS47	A8MTI9	375 aa		12.04	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	PRSS1	P07477	247 aa		12.04	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	RIPPLY3	P57055	190 aa		12.04	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		12.04	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	VPS13C	Q709C8	3753 aa		12.04	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626		H3BUA1	57 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	NDUFA4	O00483	81 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	AVP	P01185	164 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	LINC00477	Q96M19	166 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	ODF1	Q14990	250 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	ZMAT4	Q9H898	229 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		12.03	□□□□□ -0.48
FBXL12-208	ENST00000589626		H3BRM9	83 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	OVOL1	O14753	267 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	GAS8-AS1	O95177	125 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	BRI3	O95415	125 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	IGKC	P01834	107 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	LAGE3	Q14657	143 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	ERAS	Q7Z444	233 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	MRAP2	Q96G30	205 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		12.02	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	IGF1	P05019	195 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	FOXE3	Q13461	319 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	12.01	□□□□□ -0.49	2e-9	■■■□□ 18.6
FBXL12-208	ENST00000589626	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	F8	P00451	2351 aa		12.01	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	DPM2	O94777	84 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	NRAC	Q8N912	160 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		12	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626		H3BVH4	76 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	SMR3A	Q99954	134 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	AKAP9	Q99996	3911 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	C9orf118	A6NHY6	69 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	TCTA	P57738	103 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	PCP2	Q8IVA1	136 aa		11.99	□□□□□ -0.49
FBXL12-208	ENST00000589626	HIGD1B	Q9P298	99 aa		11.99	□□□□□ -0.49

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