RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAF4-215ENST00000584944 FAM222AQ5U5X8 452 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAF4-215ENST00000584944 ZFAND6Q6FIF0 208 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAF4-215ENST00000584944 PRR27Q6MZM9 219 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAF4-215ENST00000584944 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00467Q9BRT7 94 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAF4-215ENST00000584944 BIN3Q9NQY0 253 aa9.97□□□□□ -0.81
TRAF4-215ENST00000584944 DEFB130BP0DP73 79 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 DEFB130AP0DP74 79 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 OR5I1Q13606 314 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 DERL1Q9BUN8 251 aa9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.95□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 DKK2Q9UBU2 259 aa9.95□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TRGV2A0A075B6R0 118 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 RAB19A4D1S5 217 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 NUPR2A6NF83 97 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 B4DEV8 164 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 HTN3P15516 51 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZQT7 251 aa9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 M0R036 132 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 SH2D1AO60880 128 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 ASIPP42127 132 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TDRG1Q3Y452 100 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 SMIM12Q96EX1 92 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 PARLQ9H300 379 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 CELA1Q9UNI1 258 aa9.93□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF727A8MUV8 499 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TCL1AP56279 114 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 SPXQ9BT56 116 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.92□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 GAGE12BA1L429 117 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 GNRH2O43555 120 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 GAGE7O76087 117 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 GAGE12FP0CL80 117 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 GAGE12GP0CL81 117 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 GAGE12IP0CL82 117 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZTC4 211 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 COX8CQ7Z4L0 72 aa9.91□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 XKRY2A2RUG3 117 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 C9JCJ5 164 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 P01737 135 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 TYMSP04818 313 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 ATP5G1P05496 136 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 C12orf74Q32Q52 190 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 CLLU1Q5K131 121 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 MDFICQ9P1T7 246 aa9.9□□□□□ -0.82
TRAF4-215ENST00000584944 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.89□□□□□ -0.83
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TRAF4-215ENST00000584944 LGALS9BQ3B8N2 356 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 FAM74A3Q4VXF1 159 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 SOHLH1Q5JUK2 328 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 C11orf72Q8NBR9 251 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 MLST8Q9BVC4 326 aa9.89□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 F5H768 121 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 M0R2P5 195 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZTI0 123 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 SYT8Q8NBV8 401 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.88□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 CRIP1P50238 77 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 IFITM2Q01629 132 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 LINC01559Q495D7 138 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF876PQ49A33 203 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 OR2D3Q8NGH3 330 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 TPPP3Q9BW30 176 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.87□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.86□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.86□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.86□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 IGLL5B9A064 214 aa9.86□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 H3BVH4 76 aa9.86□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 SPINK4O60575 86 aa9.86□□□□□ -0.83
TRAF4-215ENST00000584944 ERVFC1-1P60608 527 aa9.86□□□□□ -0.83
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