RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 Q6ZQT7 251 aa16.08■□□□□ 0.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A087WW49 117 aa16.07■□□□□ 0.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TNFRSF6BO95407 300 aa16.07■□□□□ 0.16
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WFDC11Q8NEX6 87 aa16■□□□□ 0.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LINC01619G3V211 115 aa15.98■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TSPOP30536 169 aa15.98■□□□□ 0.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AP1S3Q96PC3 154 aa15.96■□□□□ 0.15
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.96■□□□□ 0.15
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FXYD7P58549 80 aa15.95■□□□□ 0.14
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLURP1P55000 103 aa15.94■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PMCHL2Q9BQD1 86 aa15.94■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAV2A0A0B4J234 112 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPP1R17O96001 155 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR1N2Q8NGR9 330 aa15.93■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LAGE3Q14657 143 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BATFQ16520 125 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C20orf78Q9BR46 151 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DEFB136Q30KP8 78 aa15.92■□□□□ 0.14
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa15.92■□□□□ 0.14
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