RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	IFNA5	P01569	189 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	GNG5	P63218	68 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF266	Q14584	549 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304		Q5BKY6	102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6AWC8	147 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	HYLS1	Q96M11	299 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	UPK3B	Q9BT76	320 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304		Q9H8V8	135 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ZEB1-223	ENST00000561304	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		F6UZH7	168 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	SFTA3	P0C7M3	94 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	CSN1S1	P47710	185 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TAS2R45	P59539	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF415	Q09FC8	603 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	FHL2	Q14192	279 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	SGK494	Q96LW2	274 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	OTOR	Q9NRC9	128 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	PGP	A6NDG6	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	PTTG1	O95997	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	CRYBA4	P53673	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF479	Q96JC4	524 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	AQP10	Q96PS8	301 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	BATF3	Q9NR55	127 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	NAGK	Q9UJ70	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	RNF222	A6NCQ9	220 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		G3V3Q6	166 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	GNRH2	O43555	120 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TYMS	P04818	313 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	STAG3L2	P0CL84	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	STAG3L3	P0CL85	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ATP6V0C	P27449	155 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TMED6	Q8WW62	240 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1W2PPV4	95 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	C16orf90	A8MZG2	172 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	GGTLC3	B5MD39	225 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	NXPH4	O95158	308 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	GCHFR	P30047	84 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC00315	P59091	139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TDRG1	Q3Y452	100 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TTC32	Q5I0X7	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	SUN5	Q8TC36	379 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	MED28	Q9H204	178 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	PRO0255	Q9UI72	69 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A1W2PPQ1	181 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		K7EQD1	137 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV2-11	P01706	119 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6	2e-6	■■■□□ 17.8
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF726P1	Q15940	193 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6ZSN1	163 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	RASL10A	Q92737	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TREM1	Q9NP99	234 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	SIVA1	O15304	175 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ZEB1-223	ENST00000561304	TCRA	P04437	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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