RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CS-233	ENST00000552688	C7orf71	A4D174	169 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	AKR1C3	P42330	323 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TAS2R60	P59551	318 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PRE2	83 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		H3BNG1	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		Q86TA4	180 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	KLLN	B2CW77	178 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		K7EQM0	130 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GCG	P01275	180 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CRISP2	P16562	243 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	RAB5C	P51148	216 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CEBPG	P53567	150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	UBE2G1	P62253	170 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		H7BYZ3	331 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688		M0R036	132 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	BCL2	P10415	239 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	OR5I1	Q13606	314 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	FRZB	Q92765	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GNRH2	O43555	120 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GAGE7	O76087	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	IFNA1	P01562	189 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	PPT1	P50897	306 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ESRG	Q1W209	222 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CS-233	ENST00000552688	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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