RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 C9JCJ5 164 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 CRYGDP07320 174 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 OR10J4P0C629 311 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 PET100P0DJ07 73 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 LINC01620Q4KN68 170 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 KHDC3LQ587J8 217 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 ATP5SQ99766 215 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.4□□□□□ -1.22
RNF4-218ENST00000513284 DEFA1P59665 94 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 DEFA3P59666 94 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 RANP62826 216 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 MUC21Q5SSG8 566 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PRR9Q5T870 116 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 Q6AWC8 147 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 OR10G4Q8NGN3 311 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 Q8TAT8 98 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TMED6Q8WW62 240 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 RASL10AQ92737 203 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 FXYD5Q96DB9 178 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 BATF3Q9NR55 127 aa7.39□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 K7EQD1 137 aa7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PSCAO43653 123 aa7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 GYPEP15421 78 aa7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TMEM183BQ1AE95 376 aa7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 NAGKQ9UJ70 344 aa7.38□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 DIRC3C9JPN6 131 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 M0R2P5 195 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 SSNA1O43805 119 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 CIDEAO60543 219 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 MPC2O95563 127 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 ASIPP42127 132 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 KCNS1Q96KK3 526 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 OTORQ9NRC9 128 aa7.37□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 A0A1W2PPV4 95 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 SFTA3P0C7M3 94 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PPT1P50897 306 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 ZNF479Q96JC4 524 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 HYLS1Q96M11 299 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 CHAC1Q9BUX1 264 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.36□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PGPA6NDG6 321 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 RPL12P30050 165 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TDRG1Q3Y452 100 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 Q6ZQT7 251 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 Q9HAA7 133 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 HSPB11Q9Y547 144 aa7.35□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.34□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TIRAPP58753 221 aa7.34□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.34□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 WFDC1Q9HC57 220 aa7.34□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 TREM1Q9NP99 234 aa7.34□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 MBD2Q9UBB5 411 aa7.34□□□□□ -1.23
RNF4-218ENST00000513284 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 K7EQM0 130 aa7.33□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 RHOHQ15669 191 aa7.33□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.33□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa7.33□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.33□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 ALG5Q9Y673 324 aa7.33□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 LECT2O14960 151 aa7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 TYMSP04818 313 aa7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 ZFP69Q49AA0 526 aa7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 ASB13Q8WXK3 278 aa7.32□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 F6UZH7 168 aa7.31□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 GNRH2O43555 120 aa7.31□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 PTTG1O95997 202 aa7.31□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 TAAR5O14804 337 aa7.3□□□□□ -1.24
RNF4-218ENST00000513284 RS1O15537 224 aa7.3□□□□□ -1.24
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