RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 TAAR5O14804 337 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 TYMSP04818 313 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 SFTA3P0C7M3 94 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 CRYBA4P53673 196 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNS1Q96KK3 526 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 SDF2L1Q9HCN8 221 aa11.55□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 SMLR1H3BR10 107 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 TTC32Q5I0X7 151 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 PRNTQ86SH4 94 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF479Q96JC4 524 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 CYTL1Q9NRR1 136 aa11.54□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 M0R2P5 195 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 GCGP01275 180 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV2-11P01706 119 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 TNP2Q05952 138 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.53□□□□□ -0.56
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2G2P60604 165 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFP69Q49AA0 526 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 SMUG1Q53HV7 270 aa11.52□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PPQ1 181 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 IFNA7P01567 189 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PFN1P07737 140 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.51□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV34A0A0B4J273 112 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00479Q96M42 142 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PKHD1P08F94 4074 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM74A7A6NL05 159 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 K7EQD1 137 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 SIVA1O15304 175 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 NXPH4O95158 308 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 SRIP30626 198 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PPT1P50897 306 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa11.49□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 C9JCJ5 164 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PEX7O00628 323 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 ORM1P02763 201 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 GYPEP15421 78 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF345Q14585 488 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa11.48□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 MED14OSP0DP75 135 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF876PQ49A33 203 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF575Q86XF7 245 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 HMSDA8MTL9 139 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 FHITP49789 147 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 Q86TA4 180 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 STOML3Q8TAV4 291 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf85Q96MD7 179 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP4-211ENST00000493436 PKD1P98161 4303 aa11.46□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 HERC2O95714 4834 aa11.46□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0D9SG52 128 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 FABP5P3A8MUU1 101 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 RS1O15537 224 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 SEC11BP0C7V7 166 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 CST9LP1Q5W188 147 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 DPPA3Q6W0C5 159 aa11.44□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 PGPEP1LA6NFU8 196 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 BCL2L11O43521 198 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 S100A4P26447 101 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00315P59091 139 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 CFAP126Q5VTH2 177 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM213BQ8TBF2 198 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 PTH2Q96A98 100 aa11.43□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 UMAD1C9J7I0 102 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 CIDEAO60543 219 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2G1P62253 170 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 SFT2D1Q8WV19 159 aa11.42□□□□□ -0.58
SH3BP4-211ENST00000493436 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.5 ms