RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487008.1

RAB17-211, Transcript of RAB17, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB17, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB17-211	ENST00000487008	SPINK4	O60575	86 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	FMC1	Q96HJ9	113 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	KCNS1	Q96KK3	526 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	C18orf15	Q96N68	181 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	AKR1C3	P42330	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	UBE2G1	P62253	170 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RAB17-211	ENST00000487008	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	TYMS	P04818	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008		P0DMU3	169 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	CCL20	P78556	96 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	SPX	Q9BT56	116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	GNRH2	O43555	120 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	LTA	P01374	205 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	HOXA5	P20719	270 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	OR5I1	Q13606	314 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	RASL10A	Q92737	203 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008		M0R2P5	195 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	IFNA1	P01562	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	MUC4	Q99102	2169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008		H3BNG1	76 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	NUDT3	O95989	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	CRIP1	P50238	77 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB17-211	ENST00000487008	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	SH2D1A	O60880	128 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	IGHV3-53	P01767	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	RNF212	Q495C1	297 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	KMT2A	Q03164	3969 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008		A0A0J9YY99	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	ORM1	P02763	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	BCL2	P10415	239 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008		B4DEV8	164 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	PDE6D	O43924	150 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	BLOC1S1	P78537	153 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	SLA	Q13239	276 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	VAX2	Q9UIW0	290 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008		M0R036	132 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	ASIP	P42127	132 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	FHL2	Q14192	279 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF876P	Q49A33	203 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	ZNF479	Q96JC4	524 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	DERL1	Q9BUN8	251 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	PRO0255	Q9UI72	69 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008		C9JCJ5	164 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	SFTA3	P0C7M3	94 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	LINC01559	Q495D7	138 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	PTH2	Q96A98	100 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	PAX4	O43316	350 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	CRYBA4	P53673	196 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	CCL18	P55774	89 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB17-211	ENST00000487008	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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