RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 TMEM218A2RU14 115 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 LYRM9A8MSI8 78 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 KIR3DS1Q14943 382 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 ZNF674Q2M3X9 581 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 Q86TA4 180 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 LINC01587Q99440 93 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 F5H768 121 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 K7EQM0 130 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 NUDT3O95989 172 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
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PRAME-212ENST00000485532 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 Q8TAT8 98 aa8.85□□□□□ -0.99
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PRAME-212ENST00000485532 UBE2G1P62253 170 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 TNP2Q05952 138 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 CENPWQ5EE01 88 aa8.84□□□□□ -0.99
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PRAME-212ENST00000485532 TVP23CQ96ET8 276 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 LINC00477Q96M19 166 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-212ENST00000485532 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 C9JCJ5 164 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 LTAP01374 205 aa8.83□□□□□ -1
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PRAME-212ENST00000485532 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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PRAME-212ENST00000485532 CBY3A6NI87 242 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 F8W036 122 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ATP5G1P05496 136 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 GNG4P50150 75 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 C10orf91Q5T1B1 145 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 BAGE2Q86Y30 109 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.82□□□□□ -1
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PRAME-212ENST00000485532 C8orf49Q96NF6 230 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 SEC11CQ9BY50 192 aa8.82□□□□□ -1
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PRAME-212ENST00000485532 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 C16orf74Q96GX8 76 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ODF3Q96PU9 254 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 MLST8Q9BVC4 326 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 NAT8Q9UHE5 227 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.81□□□□□ -1
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PRAME-212ENST00000485532 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 CRISP2P16562 243 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 PRR9Q5T870 116 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 OCC1Q8TAD7 63 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 LY96Q9Y6Y9 160 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 K7EN84 100 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ATP6V1G1O75348 118 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 RPL23P62829 140 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 LINC01551Q86U37 167 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 C6orf223Q8N319 242 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 SMIM12Q96EX1 92 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 HSPG2P98160 4391 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 A0A0J9YY99 117 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 KLLNB2CW77 178 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 H7BYZ3 331 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-212ENST00000485532 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
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