RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479495.5

QARS-215, Transcript of glutaminyl-tRNA synthetase, human

TSL 4

Gene QARS, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
QARS-215	ENST00000479495	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495		M0R3E3	92 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	MIF	P14174	115 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	TFPI2	P48307	235 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495		Q86TA4	180 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	SGK494	Q96LW2	274 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	ZNF492	Q9P255	531 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	PSG8	Q9UQ74	426 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495		V9GYV3	84 aa		6.5	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	C1orf196	B1AJZ1	125 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	CHEK1	O14757	476 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	TNP2	Q05952	138 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495		A0A1W2PPQ1	181 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	RBAKDN	A6NC62	111 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	EPM2A	B3EWF7	344 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	TYMS	P04818	313 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	RAB5B	P61020	215 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	NUDT11	Q96G61	164 aa		6.48	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	SOCS3	O14543	225 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	PAFAH1B2	P68402	229 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	C12orf74	Q32Q52	190 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	PRR27	Q6MZM9	219 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	STH	Q8IWL8	128 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	C16orf92	Q96LL3	132 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	NRN1	Q9NPD7	142 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	CELA1	Q9UNI1	258 aa		6.47	□□□□□ -1.37
QARS-215	ENST00000479495	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	CT83	Q5H943	113 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	TCF24	Q7RTU0	167 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	RNF182	Q8N6D2	247 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	VGLL1	Q99990	258 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		6.46	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495		A8MWL6	223 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	PRAC2	D3DTV9	90 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495		P01737	135 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	TRGC2	P03986	189 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	DEFB131A	P59861	70 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	COX19	Q49B96	90 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	ZFP82	Q8N141	532 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	TSKU	Q8WUA8	353 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495		X6R8D5	127 aa		6.45	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	CT45A10	P0DMU9	189 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	ID1	P41134	155 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	CRIP1	P50238	77 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	ERCC8	Q13216	396 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.44	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	PHOX2A	O14813	284 aa		6.43	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	TRGC1	P0CF51	173 aa		6.43	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	ZNF138	P52744	262 aa		6.43	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	SMUG1	Q53HV7	270 aa		6.43	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.43	□□□□□ -1.38
QARS-215	ENST00000479495	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		6.43	□□□□□ -1.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 2008.7 ms