RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM213A2RRL7 107 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 F8WDY8 70 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 H0YGX0 51 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 M0QXV9 152 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM236CP0DP71 79 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 NTF4P34130 210 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 FOXI1Q12951 378 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 AMTNQ6UX39 209 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SEM1Q6ZVN7 128 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 STHQ8IWL8 128 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A087WX48 190 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C5orf63A6NC05 138 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 H3BT86 120 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RHODO00212 210 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CRLF1O75462 422 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGLC1P0CG04 106 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CD69Q07108 199 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C8orf31Q8N9H6 132 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGFBPL1Q8WX77 278 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 RNF183Q96D59 192 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SIRPDQ9H106 197 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 BUB3O43684 328 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 HAPLN4Q86UW8 402 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 USMG5Q96IX5 58 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC01587Q99440 93 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 DENND4CQ5VZ89 1909 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 F8VRH5 84 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PAX8Q06710 450 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 WFDC11Q8NEX6 87 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.54□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LAMA3Q16787 3333 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PDE6GP18545 87 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-202ENST00000412318 RBX1P62877 108 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-202ENST00000412318 Q6ZWC4 215 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 GLMPQ8WWB7 406 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 PLCE1Q9P212 2302 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-202ENST00000412318 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 NMSQ5H8A3 153 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 Q6P435 159 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM231DQ6ZW35 169 aa3.53□□□□□ -1.84
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ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF524Q96C55 264 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C15orf61A6NNL5 157 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IGLL5B9A064 214 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 HTN3P15516 51 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 ERCC8Q13216 396 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 IL15RAQ13261 267 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 C15orf32Q32M92 178 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 LIME1Q9H400 295 aa3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28-202ENST00000412318 CHD9Q3L8U1 2897 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 C19orf84I3L1E1 186 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 WISP2O76076 250 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 Q6ZVH6 145 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 TRANK1O15050 2925 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 NDUFB1O75438 58 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28-202ENST00000412318 FHL1Q13642 323 aa3.52□□□□□ -1.85
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