RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.03□□□□□ -0.32
LTV1-201ENST00000367576 IMMP2LQ96T52 175 aa13.03□□□□□ -0.32
LTV1-201ENST00000367576 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.02□□□□□ -0.32
LTV1-201ENST00000367576 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.02□□□□□ -0.32
LTV1-201ENST00000367576 ZNF575Q86XF7 245 aa13.02□□□□□ -0.32
LTV1-201ENST00000367576 NUP35Q8NFH5 326 aa13.02□□□□□ -0.32
LTV1-201ENST00000367576 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
LTV1-201ENST00000367576 XKRY2A2RUG3 117 aa13.02□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 INSP01308 110 aa13.02□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 SSTP61278 116 aa13.02□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.02□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 GNRH2O43555 120 aa13.01□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 FAM159AQ6UWV7 190 aa13.01□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa13.01□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa13□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 HTN1P15515 57 aa13□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa13□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 FAM210BQ96KR6 192 aa13□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 H3BVH4 76 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 SPRY2O43597 315 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 AMBPP02760 352 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 PRM2P04554 102 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 TYMSP04818 313 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 SAMD5Q5TGI4 173 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 LYZL1Q6UWQ5 148 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 BTF3L4Q96K17 158 aa12.99□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa12.98□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.98□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 RAB5AP20339 215 aa12.98□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 PYGO2Q9BRQ0 406 aa12.98□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 ARMS2P0C7Q2 107 aa12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 IGLC6P0CF74 106 aa12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 ASIPP42127 132 aa12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 LINC01587Q99440 93 aa12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 TMEM208Q9BTX3 173 aa12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 S100A4P26447 101 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.97□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 FAM231BA6NCW3 169 aa12.96□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 CBY3A6NI87 242 aa12.96□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.96□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 RPS10P46783 165 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 KCNS1Q96KK3 526 aa12.96□□□□□ -0.33
LTV1-201ENST00000367576 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 CAMPP49913 170 aa12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 CSTL1Q9H114 145 aa12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 CTRLP40313 264 aa12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 OR10AG1Q8NH19 301 aa12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 MDFICQ9P1T7 246 aa12.95□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 RAB4BP61018 213 aa12.94□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 TDRG1Q3Y452 100 aa12.94□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 BORCS7Q96B45 105 aa12.94□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa12.93□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GUT8 65 aa12.93□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.93□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa12.93□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa12.93□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 ANK2Q01484 3957 aa12.93□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.92□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 A0A1B0GXF2 115 aa12.92□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.92□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 MSRB1Q9NZV6 116 aa12.92□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 TRGV11A0A075B6L2 103 aa12.91□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 HBBP68871 147 aa12.91□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 RIGQ13278 110 aa12.91□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 SNURFLB1AK76 121 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 M0R381 172 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 SNAI2O43623 268 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 OR5AL1P0C617 328 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 AZU1P20160 251 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 TWIST1Q15672 202 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 F2Z2F3 143 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 NTF3P20783 257 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 APOC4P55056 127 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 SPANXN1Q5VSR9 72 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 TMEM136Q6ZRR5 245 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 FRZBQ92765 325 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa12.9□□□□□ -0.34
LTV1-201ENST00000367576 DEFB135Q30KP9 77 aa12.89□□□□□ -0.35
LTV1-201ENST00000367576 DNLZQ5SXM8 178 aa12.89□□□□□ -0.35
LTV1-201ENST00000367576 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa12.89□□□□□ -0.35
LTV1-201ENST00000367576 TRGC2P03986 189 aa12.88□□□□□ -0.35
LTV1-201ENST00000367576 C9orf85Q96MD7 179 aa12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms