RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026474.4

Gli1-201, Transcript of Zinc finger protein GLI1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gli1, Length 4,057 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ighv1-58A0A075B5W9 117 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Spem1Q5F289 310 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Patz1Q5NBY9 687 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sft2d1Q5SSN7 159 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nup62Q63850 526 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mrpl51Q9CPY1 128 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ankrd17Q99NH0 2603 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mmp27D3YV89 551 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm10036E9PYL9 178 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nudt10P0C027 164 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nudt11P0C028 164 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rtl4Q3URY0 304 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sval2Q99N75 144 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cldn23Q9D7D7 296 aa11.66□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cldn1O88551 211 aa11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm9Q3UKW5 162 aa11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem147Q9CQG6 224 aa11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp459Q8BZ17 267 aa11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gar1Q9CY66 231 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Reg1P43137 165 aa11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 AcanQ61282 2132 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fam206aQ80ZQ9 193 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ttc9cQ810A3 171 aa11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn1r66Q8K4I0 310 aa11.65□□□□□ -0.54
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tcrg-V5A0A0G2JGV5 113 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1220F7BL62 311 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 E030018B13RikJ3QMS9 113 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 SlpiP97430 131 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Klre1Q8CJC7 226 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ccdc198Q9CPZ1 294 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 IcaQ9DBD0 700 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn1r61W4VSP5 300 aa11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Zfp462B1AWL2 2495 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm17677B3GLJ5 116 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Adrb3P25962 400 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ifna14Q810G3 189 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm17334Q8C6U3 126 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ndufs8Q8K3J1 212 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr346Q8VGJ7 309 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr206Q8VGP9 306 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Rhebl1Q9D8T3 184 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Plekha2Q9ERS5 425 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 RprmQ9JJ72 109 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 CortP56469 109 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Slc35e1Q8CD26 409 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Vmn1r211Q8R266 298 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr802Q8VGJ2 312 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Chrdl1Q920C1 447 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Sfxn4Q925N1 313 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 9130008F23RikQ9D2Z6 181 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Wrap73Q9JM98 462 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 StrapQ9Z1Z2 350 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trav12d-1A0N8R0 115 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm21244J3QK38 227 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Serf1O88892 62 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 GbaP17439 515 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Fabp7P51880 132 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 B3gnt9Q8VI16 399 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Lipt2Q9D009 231 aa11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trav6d-3A0A075B6B3 112 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hspb7P35385 169 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dlx6P70397 175 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trav6-3Q5R1E6 112 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1204Q7TR10 309 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hsbp1Q9CQZ1 76 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Nubp1Q9R060 320 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mef2bO55087 349 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gls2Q571F8 602 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 PhyhiplQ8BGT8 375 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Alkbh7Q9D6Z0 221 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr1124A2AT86 318 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ly6g6fB2RXM6 300 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dynlt3P56387 116 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Dhrs2Q149L0 282 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trim63Q38HM4 350 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm1673Q3UR78 90 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Scgb1b27Q91WB5 92 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Bpifa5Q9CQX3 270 aa11.63□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 AY761185Q5ERI8 94 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Mmp28Q8CGV8 520 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Trappc2lQ9JME7 139 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gsx1P31315 261 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr823Q7TRH2 315 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Prima1Q810F0 153 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm10309Q8C648 119 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr824Q8VFU4 315 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Ms4a6cQ99N08 217 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Angptl4Q9Z1P8 410 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gm44596A0A0N4SVA0 210 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Tmem107Q9CPV0 140 aa11.62□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Pitx3O35160 302 aa11.61□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Csn1s2bP02664 143 aa11.61□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Hoxa1P09022 331 aa11.61□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Cdk2P97377 346 aa11.61□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Gp2Q9D733 531 aa11.61□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 Olfr177E9Q7W1 309 aa11.61□□□□□ -0.55
Gli1-201ENSMUST00000026474 LtbP41155 306 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.5 ms