Protein–RNA interactions for Protein: P0C028

Nudt11, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 3-beta, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt11P0C028 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nudt11P0C028 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nudt11P0C028 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nudt11P0C028 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nudt11P0C028 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nudt11P0C028 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nudt11P0C028 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nudt11P0C028 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nudt11P0C028 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nudt11P0C028 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nudt11P0C028 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nudt11P0C028 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nudt11P0C028 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nudt11P0C028 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Nudt11P0C028 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nudt11P0C028 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nudt11P0C028 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nudt11P0C028 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Nudt11P0C028 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nudt11P0C028 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nudt11P0C028 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nudt11P0C028 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nudt11P0C028 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nudt11P0C028 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nudt11P0C028 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nudt11P0C028 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nudt11P0C028 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nudt11P0C028 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nudt11P0C028 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nudt11P0C028 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nudt11P0C028 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nudt11P0C028 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nudt11P0C028 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nudt11P0C028 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nudt11P0C028 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nudt11P0C028 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Nudt11P0C028 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nudt11P0C028 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nudt11P0C028 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nudt11P0C028 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nudt11P0C028 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nudt11P0C028 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nudt11P0C028 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudt11P0C028 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nudt11P0C028 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nudt11P0C028 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nudt11P0C028 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nudt11P0C028 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nudt11P0C028 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nudt11P0C028 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudt11P0C028 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudt11P0C028 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudt11P0C028 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudt11P0C028 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudt11P0C028 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudt11P0C028 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudt11P0C028 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudt11P0C028 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nudt11P0C028 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nudt11P0C028 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nudt11P0C028 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nudt11P0C028 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudt11P0C028 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nudt11P0C028 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt11P0C028 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nudt11P0C028 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nudt11P0C028 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nudt11P0C028 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nudt11P0C028 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nudt11P0C028 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nudt11P0C028 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nudt11P0C028 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nudt11P0C028 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nudt11P0C028 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nudt11P0C028 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nudt11P0C028 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nudt11P0C028 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nudt11P0C028 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nudt11P0C028 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nudt11P0C028 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nudt11P0C028 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nudt11P0C028 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nudt11P0C028 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nudt11P0C028 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nudt11P0C028 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nudt11P0C028 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nudt11P0C028 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nudt11P0C028 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nudt11P0C028 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nudt11P0C028 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nudt11P0C028 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nudt11P0C028 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nudt11P0C028 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nudt11P0C028 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nudt11P0C028 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nudt11P0C028 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nudt11P0C028 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nudt11P0C028 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nudt11P0C028 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nudt11P0C028 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms