Protein–RNA interactions for Protein: P56469

Cort, Cortistatin, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CortP56469 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CortP56469 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CortP56469 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CortP56469 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CortP56469 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CortP56469 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CortP56469 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CortP56469 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CortP56469 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CortP56469 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CortP56469 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CortP56469 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CortP56469 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CortP56469 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CortP56469 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CortP56469 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CortP56469 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CortP56469 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CortP56469 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CortP56469 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CortP56469 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CortP56469 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CortP56469 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CortP56469 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CortP56469 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CortP56469 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CortP56469 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CortP56469 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CortP56469 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CortP56469 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CortP56469 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CortP56469 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CortP56469 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CortP56469 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CortP56469 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CortP56469 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CortP56469 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CortP56469 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CortP56469 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CortP56469 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CortP56469 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CortP56469 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CortP56469 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CortP56469 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CortP56469 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CortP56469 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CortP56469 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CortP56469 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CortP56469 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CortP56469 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CortP56469 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CortP56469 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CortP56469 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CortP56469 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CortP56469 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CortP56469 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CortP56469 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CortP56469 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CortP56469 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CortP56469 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CortP56469 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CortP56469 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CortP56469 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CortP56469 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CortP56469 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CortP56469 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CortP56469 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CortP56469 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CortP56469 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CortP56469 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CortP56469 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CortP56469 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CortP56469 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CortP56469 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CortP56469 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CortP56469 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CortP56469 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CortP56469 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CortP56469 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CortP56469 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CortP56469 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CortP56469 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CortP56469 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CortP56469 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CortP56469 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CortP56469 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CortP56469 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CortP56469 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CortP56469 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CortP56469 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CortP56469 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CortP56469 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CortP56469 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CortP56469 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CortP56469 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CortP56469 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CortP56469 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CortP56469 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CortP56469 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CortP56469 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms