RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621217.4

GGA3-222, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-222ENST00000621217 IGHV4-39P01824 125 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 P0C879 139 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 SLAQ13239 276 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 SRD5A1P18405 259 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 OTORQ9NRC9 128 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 ERG28Q9UKR5 140 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 KALRNO60229 2985 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 PRR20EP86478 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 PRR20CP86479 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 PRR20DP86480 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 PRR20BP86481 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 PRR20AP86496 221 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 Q8TAT8 98 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 RNF125Q96EQ8 232 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 G3V318 75 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 PPP1R17O96001 155 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 CFAP161Q6P656 301 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.23□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 RHOGP84095 191 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 VWC2Q2TAL6 325 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 C17orf77Q96MU5 243 aa7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 A0A1W2PRX2 142 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 Q71RC1 249 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 RCHY1Q96PM5 261 aa7.21□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
GGA3-222ENST00000621217 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 D6R8Y8 96 aa7.21□□□□□ -1.26
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GGA3-222ENST00000621217 IFITM1P13164 125 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 CRYBA4P53673 196 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 V9GYV3 84 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 C5orf64Q2M2E5 130 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 PSG8Q9UQ74 426 aa7.21□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 TCRAP04437 139 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 C15orf32Q32M92 178 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
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GGA3-222ENST00000621217 H3BMG7 143 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 TAX1BP3O14907 124 aa7.2□□□□□ -1.26
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GGA3-222ENST00000621217 NDPQ00604 133 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 JMJD8Q96S16 334 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 FLNCQ14315 2725 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.2□□□□□ -1.26
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GGA3-222ENST00000621217 CGB7P0DN87 165 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 GLMPQ8WWB7 406 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 C16orf92Q96LL3 132 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 PTPRBP23467 1997 aa7.2□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 G3V4G9 280 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 SIVA1O15304 175 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 ATP5G2Q06055 141 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 PATE2Q6UY27 113 aa7.19□□□□□ -1.26
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GGA3-222ENST00000621217 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 TACC2O95359 2948 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 FABP5P3A8MUU1 101 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 C9JAW5 83 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 ATXN8Q156A1 80 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 C2orf82Q6UX34 121 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa7.19□□□□□ -1.26
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GGA3-222ENST00000621217 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 OR10J6PQ8NGY7 276 aa7.19□□□□□ -1.26
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GGA3-222ENST00000621217 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.19□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 TMEM8BA6NDV4 472 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 NCR2O95944 276 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 LGALS9BQ3B8N2 356 aa7.18□□□□□ -1.26
GGA3-222ENST00000621217 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.18□□□□□ -1.26
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