RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614825.4

DDB2-208, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene DDB2, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2-208ENST00000614825 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 C6orf223Q8N319 242 aa8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ZNF503Q96F45 646 aa8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 Q9H8V8 135 aa8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 NAGKQ9UJ70 344 aa8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.07□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 PGPA6NDG6 321 aa8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 NMBP08949 121 aa8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 TCL1AP56279 114 aa8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 RAB2AP61019 212 aa8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 TNP2Q05952 138 aa8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ESRGQ1W209 222 aa8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ZNF575Q86XF7 245 aa8.06□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 DIRC3C9JPN6 131 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 PAX4O43316 350 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 SPINK4O60575 86 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ZNF415Q09FC8 603 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 FAM74A1Q5RGS3 127 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 HERC2O95714 4834 aa8.05□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 A0A096LPF7 62 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 RBAKDNA6NC62 111 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 MED14OSP0DP75 135 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 LINC01559Q495D7 138 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 OR10G4Q8NGN3 311 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 OR10G9Q8NGN4 311 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 OR10G7Q8NGN6 311 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 C8orf49Q96NF6 230 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 MED28Q9H204 178 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 OTORQ9NRC9 128 aa8.04□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 H3BNG1 76 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 GNG5P63218 68 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ZNF266Q14584 549 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 TTC32Q5I0X7 151 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 MDFICQ9P1T7 246 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.03□□□□□ -1.12
DDB2-208ENST00000614825 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 C16orf90A8MZG2 172 aa8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 F6UZH7 168 aa8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SGK494Q96LW2 274 aa8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 PKHD1P08F94 4074 aa8.02□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 PTTG1O95997 202 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SFTA3P0C7M3 94 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 C18orf15Q96N68 181 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 TREM1Q9NP99 234 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 PRO0255Q9UI72 69 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.01□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 GNRH2O43555 120 aa8□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 ATP6V0CP27449 155 aa8□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 Q6AWC8 147 aa8□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 UPK3BQ9BT76 320 aa8□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 LENEPQ9Y5L5 61 aa8□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 PKD1P98161 4303 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SIVA1O15304 175 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 NXPH4O95158 308 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 CRYBA4P53673 196 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SLAQ13239 276 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 FHL2Q14192 279 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 ODF1Q14990 250 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 Q5BKY6 102 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 TMED6Q8WW62 240 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 RAB24Q969Q5 203 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 ZNF479Q96JC4 524 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 MUC4Q99102 2169 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SPXQ9BT56 116 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.99□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.98□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 GCHFRP30047 84 aa7.98□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SRIP30626 198 aa7.98□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.98□□□□□ -1.13
DDB2-208ENST00000614825 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.98□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.6 ms