RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 UBE2V1Q13404 147 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF738Q8NE65 137 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 LINC00479Q96M42 142 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.71□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 DIRC3C9JPN6 131 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLURP1P55000 103 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 FHL3Q13643 280 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 OCC1Q8TAD7 63 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 NRN1Q9NPD7 142 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 C2orf70A6NJV1 201 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 LTAP01374 205 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 BAGE2Q86Y30 109 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 C16orf92Q96LL3 132 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 PEMTQ9UBM1 199 aa6.7□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 K7EN84 100 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 M0QZ24 198 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 SOCS3O14543 225 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGLV2-11P01706 119 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGLV2-8P01709 118 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 EDN2P20800 178 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CBLN1P23435 193 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 TIRAPP58753 221 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 PSG3Q16557 428 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 COX19Q49B96 90 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 TCF24Q7RTU0 167 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q86TA4 180 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 SFRP2Q96HF1 295 aa6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 A0A1W2PRX2 142 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCL24O00175 119 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 HLA-DMBP28068 263 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 LCN12Q6JVE5 192 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 RNF182Q8N6D2 247 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 DUX3Q96PT4 197 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 RBAKDNA6NC62 111 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLAQ13239 276 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 SGK494Q96LW2 274 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 ASCL2Q99929 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 MLST8Q9BVC4 326 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.68□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q0VG73 95 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 BATFQ16520 125 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRNTQ86SH4 94 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 OSTCQ9NRP0 149 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 PSG8Q9UQ74 426 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 COX11Q9Y6N1 276 aa6.67□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 A8MZ25 164 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 MALP21145 153 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 DCANP1Q8TF63 244 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCL25O15444 150 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 MT-ND6P03923 174 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CSN3P07498 182 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CRISP2P16562 243 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 ID1P41134 155 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRTAP10-3P60369 221 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 PMCHL1Q16048 86 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.66□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRAC2D3DTV9 90 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 OVOL1O14753 267 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 CTRLP40313 264 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 Q6ZWC4 215 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.65□□□□□ -1.34
PRKAR1A-211ENST00000586397 C20orf173Q96LM9 149 aa6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms