RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CCL16O15467 120 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CXCL8P10145 99 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CKS2P33552 79 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2AP49459 152 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 DSCR9P59020 149 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 RPL30P62888 115 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 BLCAPP62952 87 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 INSL4Q14641 139 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SS18Q15532 418 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01554Q52M75 96 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf100Q5SVJ3 147 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 NOXRED1Q6NXP6 359 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 GFRALQ6UXV0 394 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZSV7 163 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SCXQ7RTU7 201 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 MARCH3Q86UD3 253 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A29Q8N8R3 303 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 DIRC1Q969H9 104 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 MSRB1Q9NZV6 116 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 HILPDAQ9Y5L2 63 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A15Q9Y619 301 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LY96Q9Y6Y9 160 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 MAST2Q6P0Q8 1798 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JMZ2 1700 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC37A2A6NM11 1700 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC37AA6NMS7 1700 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 DUOX1Q9NRD9 1551 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 PTPRBP23467 1997 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 C9JCJ5 164 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFC1O43677 76 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LTAP01374 205 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CCKP06307 115 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 AQP1P29972 269 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM11AP58511 58 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LCE1FQ5T754 118 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf201Q7Z4U5 140 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00643Q86TS7 51 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM252Q8N6L7 170 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CD177Q8N6Q3 437 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 Q8N8P6 123 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TXNDC17Q9BRA2 123 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IL36BQ9NZH7 164 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF492Q9P255 531 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 DOT1LQ8TEK3 1739 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 OBSL1O75147 1896 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC37A3O60309 1634 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LOC285556D6RIA3 1793 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 DLG5Q8TDM6 1919 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LMO7Q8WWI1 1683 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GW54 56 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PQD3 144 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 BMPR1BO00238 502 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 HCRTO43612 131 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 BCE1O60756 84 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF56Q15929 161 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 DEFB121Q5J5C9 76 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 FAM104BQ5XKR9 115 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP2Q6ZN57 461 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 FAM72BQ86X60 149 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01555Q8NAE3 123 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF563Q8TA94 476 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM190Q8WZ59 177 aa2.23□□□□□ -2.05
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PTPRM-204ENST00000577468 OSTCQ9NRP0 149 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IL36RNQ9UBH0 155 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 SIP14410 1827 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP2.23□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 POLEQ07864 2286 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 NRAPQ86VF7 1730 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GUV1 79 aa2.22□□□□□ -2.05
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