RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556736.5

MEG3-227, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 1,689 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-227	ENST00000556736	TRGC2	P03986	189 aa		13.63	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	DEFB1	P60022	68 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736		Q6AWC8	147 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	RASL11A	Q6T310	242 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.62	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736		A0A0J9YX75	114 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	PF4	P02776	101 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	WDR73	Q6P4I2	378 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	GTSF1	Q8WW33	167 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	ODF3	Q96PU9	254 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	CRISP2	P16562	243 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	ZFP82	Q8N141	532 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	SPINK4	O60575	86 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	SAP30	O75446	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	MT-ND6	P03923	174 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	LINC01559	Q495D7	138 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	ORM1	P02763	201 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	GPX1	P07203	203 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	GZMB	P10144	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEG3-227	ENST00000556736	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	CITED1	Q99966	193 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	PHOX2A	O14813	284 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	CD33	P20138	364 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	LEP	P41159	167 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	DEFB131A	P59861	70 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	FRZB	Q92765	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	BORCS7	Q96B45	105 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	KLLN	B2CW77	178 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	IGLV1-51	P01701	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HLA-DQA1	P01909	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	S100A6	P06703	90 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	TSPO	P30536	169 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HBB	P68871	147 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	PRR9	Q5T870	116 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		13.56	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736		A0A1B0GUT8	65 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736		A0A1B0GXF2	115 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BK	O60814	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BO	P23527	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BB	P33778	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BD	P58876	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	RAB4B	P61018	213 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BC	P62807	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	JMJD1C	Q15652	2540 aa		13.55	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736		A0A1B0GW15	77 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736		J3KRW8	73 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	TRGC1	P0CF51	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	RIG	Q13278	110 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.54	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	S100A8	P05109	93 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	TPPP3	Q9BW30	176 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	IGLC6	P0CF74	106 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	CAMP	P49913	170 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		13.53	□□□□□ -0.24
MEG3-227	ENST00000556736		A8MTW9	85 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	CTRL	P40313	264 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	CDKN1B	P46527	198 aa		13.52	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	KNCN	A6PVL3	124 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736		F2Z2F3	143 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736		H3BMM0	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	IGKV3-20	P01619	116 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		13.51	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	C7orf71	A4D174	169 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	OR11H12	B2RN74	326 aa		13.5	□□□□□ -0.25
MEG3-227	ENST00000556736	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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