RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519846.5

CLVS1-205, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLVS1, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-205ENST00000519846 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 FAM159AQ6UWV7 190 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 THAP8Q8NA92 274 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 K7EQG2 157 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 M0R2Z0 102 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 C8orf88P0DMB2 117 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SULT1A2P50226 295 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SPINK13Q1W4C9 94 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SOHLH1Q5JUK2 328 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ATRAIDQ6UW56 229 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 MTURNQ8N3F0 131 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.68□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 M0R3E3 92 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 MORN5Q5VZ52 161 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 CMTM2Q8TAZ6 248 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SGK494Q96LW2 274 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 A0A0J9YWU9 116 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 UMAD1C9J7I0 102 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SFTA3P0C7M3 94 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 CCL20P78556 96 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ICAM4Q14773 271 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PSG3Q16557 428 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 GDF5OSQ5U4N7 250 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PAXXQ9BUH6 204 aa3.67□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 C1orf196B1AJZ1 125 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 CSN1S1P47710 185 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PEA15Q15121 130 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PATE2Q6UY27 113 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 RNF183Q96D59 192 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 LINC01587Q99440 93 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 C20orf202A1L168 122 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 H3BRN7 92 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 M0R143 59 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ISLRO14498 428 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SCGB1A1P11684 91 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 RAB5CP51148 216 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 KCNIP4Q6PIL6 250 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SFRP2Q96HF1 295 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PRSS46E5RG02 174 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 IFNA1P01562 189 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 HBE1P02100 147 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 TAS2R45P59539 299 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 A0A087X0K7 114 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 TMEM218A2RU14 115 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PSMB3P49720 205 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ADIRFQ15847 76 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 C1orf194Q5T5A4 169 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SVBPQ8N300 66 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 MED9Q9NWA0 146 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 H3BQ15 152 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SLC17A3O00476 420 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 MPDU1O75352 247 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 PRM2P04554 102 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 DEFB130BP0DP73 79 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 DEFB130AP0DP74 79 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 RPL29P47914 159 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ERCC8Q13216 396 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 DNLZQ5SXM8 178 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 DCANP1Q8TF63 244 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ISOC2Q96AB3 205 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 C20orf173Q96LM9 149 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa3.65□□□□□ -1.82
CLVS1-205ENST00000519846 ANK2Q01484 3957 aa3.65□□□□□ -1.83
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF727A8MUV8 499 aa3.65□□□□□ -1.83
CLVS1-205ENST00000519846 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
CLVS1-205ENST00000519846 SERF2P84101 59 aa3.65□□□□□ -1.83
CLVS1-205ENST00000519846 PSG9Q00887 426 aa3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms