RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYPLA2O95372 231 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 HLA-DRB1P01911 266 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 IVLP07476 585 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 SRP14P37108 136 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 MYL5Q02045 173 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 FADDQ13158 208 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 RHOHQ15669 191 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q5VV11 94 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM45BPQ6NSW5 357 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 ALKAL1Q6UXT8 129 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 C4orf33Q8N1A6 199 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa-4.39□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 NISCHQ9Y2I1 1504 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 BBIP1A8MTZ0 92 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC35E2BP0CK96 405 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN8P56748 225 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 CFAP126Q5VTH2 177 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR4B1Q8NGF8 309 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM172AQ8WUF8 416 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC77Q9BR77 488 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPCDR1Q9BY65 106 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR51I1Q9H343 314 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENPP5Q9UJA9 477 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 ASB4Q9Y574 426 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUP155O75694 1391 aa-4.4□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 USP54Q70EL1 1684 aa-4.41□□□□□ -3.11
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRYZL1O95825 349 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCL2P10415 239 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 SDC4P31431 198 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 S100A3P33764 101 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 V9GYV3 84 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGD6Q6ZV73 1430 aa-4.41□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 LYRM1O43325 122 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL18Q14116 193 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAL1Q4LDG9 190 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 C2orf50Q96LR7 162 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 IFT172Q9UG01 1749 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-4.42□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 KNDC1Q76NI1 1749 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2H2O95918 312 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 ORM1P02763 201 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 BCAP31P51572 246 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 CLDN12P56749 244 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 PIGPP57054 158 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 DEFA1P59665 94 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMED1Q13445 227 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 RSU1Q15404 277 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR10X1Q8NGY0 326 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 AMELXQ99217 191 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAF9BQ9HBM6 251 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 C19orf12Q9NSK7 152 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX16Q9P0S2 106 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 ROBO3Q96MS0 1386 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEP164Q9UPV0 1460 aa-4.43□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 WRBO00258 174 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDC42EP2O14613 210 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 AP3S2P59780 193 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00523Q86TU6 105 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAFIPQ8WZ33 124 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR2H1Q9GZK4 316 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 NT5C3AQ9H0P0 336 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 ENY2Q9NPA8 101 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-4.44□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GW15 77 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL5CA6NH57 179 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 EVPLLA8MZ36 301 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINA1P01009 418 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR8J2Q8NGG1 315 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 COX7B2Q8TF08 81 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 TEX37Q96LM6 180 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 WFDC6Q9BQY6 131 aa-4.45□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1W2PPV4 95 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 J3KT08 172 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 CST7O76096 145 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 DYNLT3P51808 116 aa-4.46□□□□□ -3.12
RNU6-871P-201ENST00000516122 PMAIP1Q13794 54 aa-4.46□□□□□ -3.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms