RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DIRC3C9JPN6 131 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF266Q14584 549 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CMTM2Q8TAZ6 248 aa16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PGPA6NDG6 321 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF415Q09FC8 603 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM74A1Q5RGS3 127 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUC21Q5SSG8 566 aa16.17■□□□□ 0.18
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VSIG2Q96IQ7 327 aa16.17■□□□□ 0.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10G7Q8NGN6 311 aa16.15■□□□□ 0.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 MUC4Q99102 2169 aa16.15■□□□□ 0.18
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A096LPF7 62 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTTG1O95997 202 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTC32Q5I0X7 151 aa16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAX4O43316 350 aa16.13■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.13■□□□□ 0.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMED6Q8WW62 240 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MDFICQ9P1T7 246 aa16.12■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM183BQ1AE95 376 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF575Q86XF7 245 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM183AQ8IXX5 376 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRO0255Q9UI72 69 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NAGKQ9UJ70 344 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ICOSQ9Y6W8 199 aa16.11■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf49Q96NF6 230 aa16.09■□□□□ 0.17
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AQP10Q96PS8 301 aa16.09■□□□□ 0.17
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa16.08■□□□□ 0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 TREM1Q9NP99 234 aa16.07■□□□□ 0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAG3L3P0CL85 134 aa16.06■□□□□ 0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB24Q969Q5 203 aa16.06■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV21A0A0B4J279 112 aa16.05■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GNRH2O43555 120 aa16.05■□□□□ 0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SFTA3P0C7M3 94 aa16.05■□□□□ 0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 GIPP09681 153 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERF2P84101 59 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TDRG1Q3Y452 100 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RASL10AQ92737 203 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TVP23CQ96ET8 276 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF479Q96JC4 524 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SGK494Q96LW2 274 aa16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIVA1O15304 175 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASB13Q8WXK3 278 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDFIP1Q9BT67 221 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.03■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7EQM0 130 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NXPH4O95158 308 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IQCF2Q8IXL9 164 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C5orf17Q8NAS9 161 aa16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa16.01■□□□□ 0.15
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.01■□□□□ 0.15
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