RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 TM4SF20Q53R12 229 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 NRN1Q9NPD7 142 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM160Q9NX00 188 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 IQCJQ1A5X6 159 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 Q6ZWC4 215 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF575Q86XF7 245 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TEX29Q8N6K0 151 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 BORCS7Q96B45 105 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 C20orf173Q96LM9 149 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SMPXQ9UHP9 88 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 IGLC6P0CF74 106 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 CTRLP40313 264 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 LINC01559Q495D7 138 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 Q8N2B8 174 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 RNF152Q8N8N0 203 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 SRD5A1P18405 259 aa6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 AMTP48728 403 aa6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 PRR31Q5SQ13 230 aa6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF738Q8NE65 137 aa6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 TPPP3Q9BW30 176 aa6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.21□□□□□ -1.41
PDE4D-208ENST00000502484 OVOL1O14753 267 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ORM1P02763 201 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM86BQ8N661 226 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ATRQ13535 2644 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00587B1AMM8 73 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 SCGB1D1O95968 90 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 PMCHP20382 165 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 REC114Q7Z4M0 266 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00477Q96M19 166 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 CNFNQ9BYD5 112 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 NAGKQ9UJ70 344 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 CUBNO60494 3623 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM213A2RRL7 107 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 CRLF1O75462 422 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 EDN2P20800 178 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 PKIAP61925 76 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 NIT1Q86X76 327 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 LGALS9O00182 355 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 HSBP1O75506 76 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 CD33P20138 364 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 DUX5Q96PT3 197 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 RNF114Q9Y508 228 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WW49 117 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 SCGB2A2Q13296 93 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 DCANP1Q8TF63 244 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 TSTD3H0UI37 97 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 NTF3P20783 257 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 FAM104BQ5XKR9 115 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ID1P41134 155 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 TWIST1Q15672 202 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 PRR9Q5T870 116 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 M0R2Z0 102 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00614P0C842 121 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 SYNJ2BPP57105 145 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB1P60022 68 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 MUC21Q5SSG8 566 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-208ENST00000502484 AMN1Q8IY45 258 aa6.17□□□□□ -1.42
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