RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GUK1	Q16774	197 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		C9JCJ5	164 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		K7EPK0	472 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNK	O75909	580 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SFT2D2	O95562	160 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SFTA3	P0C7M3	94 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLC2	P0DOY2	106 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	CTF1	Q16619	201 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZRG5	221 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MCFD2	Q8NI22	146 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00477	Q96M19	166 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		7.23	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	KLLN	B2CW77	178 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	FNDC10	F2Z333	226 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R3E3	92 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R1A	Q13522	171 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB31	Q13636	194 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	MORN5	Q5VZ52	161 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	OXT	P01178	125 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	AP3S2	P59780	193 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	BLNK	Q8WV28	456 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF479	Q96JC4	524 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM8	Q96KF7	97 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SRR	Q9GZT4	340 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PRELID1	Q9Y255	219 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP12	A6NFH5	140 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF253	O75346	499 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-30	P01768	117 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-33	P01772	117 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMLG	P49069	296 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SOST	Q9BQB4	213 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TM2D2	Q9BX73	214 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFSF8	P32971	234 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	MUC21	Q5SSG8	566 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PFDN5	Q99471	154 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	MGST2	Q99735	147 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	GGACT	Q9BVM4	153 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	LECT2	O14960	151 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TSC22D2	O75157	780 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	NMB	P08949	121 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	CRISP2	P16562	243 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SPCS2	Q15005	226 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR9	Q5T870	116 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	MIC13	Q5XKP0	118 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZSA8	131 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511		L7N2F9	121 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	BCAP31	P51572	246 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	VAMP2	P63027	116 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	PYDC2	Q56P42	97 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZQT7	251 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SKAP2-209	ENST00000497511	SPX	Q9BT56	116 aa		7.17	□□□□□ -1.26

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