RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SPRNQ5BIV9 151 aa13.45□□□□□ -0.26
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NISCH-213ENST00000489895 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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NISCH-213ENST00000489895 PRIMA1Q86XR5 153 aa13.45□□□□□ -0.26
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NISCH-213ENST00000489895 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
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NISCH-213ENST00000489895 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.35□□□□□ -0.27
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NISCH-213ENST00000489895 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.35□□□□□ -0.27
NISCH-213ENST00000489895 ZMAT4Q9H898 229 aa13.35□□□□□ -0.27
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NISCH-213ENST00000489895 C17orf77Q96MU5 243 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-213ENST00000489895 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.34□□□□□ -0.27
NISCH-213ENST00000489895 PRORYQ9H606 182 aa13.34□□□□□ -0.27
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NISCH-213ENST00000489895 BLCAPP62952 87 aa13.33□□□□□ -0.27
NISCH-213ENST00000489895 STPG4Q8N801 248 aa13.33□□□□□ -0.27
NISCH-213ENST00000489895 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
NISCH-213ENST00000489895 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.33□□□□□ -0.27
NISCH-213ENST00000489895 MED13LQ71F56 2210 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 AJUBAQ96IF1 538 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 CTSGP08311 255 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 DNAJC30Q96LL9 226 aa13.33□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1-17P01599 117 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 NOTCH3Q9UM47 2321 aa13.32□□□□□ -0.28
NISCH-213ENST00000489895 CRYGCP07315 174 aa13.32□□□□□ -0.28
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