RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 CNIH1O95406 144 aa10.52□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 PSMG4Q5JS54 123 aa10.52□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 MYOZ3Q8TDC0 251 aa10.52□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 GLMPQ8WWB7 406 aa10.52□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 IGKV1-17P01599 117 aa10.51□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 FOXI1Q12951 378 aa10.51□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa10.51□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 FBXL15Q9H469 300 aa10.51□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.5□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 VPS13CQ709C8 3753 aa10.48□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 TGFAP01135 160 aa10.48□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 OR11H12B2RN74 326 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 H3BRN7 92 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 OR11H2Q8NH07 326 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 TAL2Q16559 108 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.47□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
NISCH-212ENST00000488380 VKORC1Q9BQB6 163 aa10.47□□□□□ -0.73
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NISCH-212ENST00000488380 DTX2Q86UW9 622 aa10.46□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
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NISCH-212ENST00000488380 SPTBN4Q9H254 2564 aa10.45□□□□□ -0.74
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NISCH-212ENST00000488380 COL12A1Q99715 3063 aa10.45□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.45□□□□□ -0.74
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NISCH-212ENST00000488380 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.44□□□□□ -0.74
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NISCH-212ENST00000488380 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
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NISCH-212ENST00000488380 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa10.44□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WX48 190 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-23P01764 117 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 IGLC6P0CF74 106 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 FHL3Q13643 280 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 AKAP6Q13023 2319 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 CHD8Q9HCK8 2581 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.43□□□□□ -0.74
NISCH-212ENST00000488380 FABP5P3A8MUU1 101 aa10.43□□□□□ -0.74
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