RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 HPGDSO60760 199 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 BAG2O95816 211 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINA7P05543 415 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 UQCRHP07919 91 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 IL7P13232 177 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CCNB1P14635 433 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CXCL3P19876 107 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 PSMA3P25788 255 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CRIP1P50238 77 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGDIBP52566 201 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SEC61GP60059 68 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SPCS3P61009 180 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 RAB11AP62491 216 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 PLGLB1Q02325 96 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 BFSP1Q12934 665 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 UBE2V1Q13404 147 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SPIN4Q56A73 249 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 METTL21CQ5VZV1 264 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 FAM180BQ6P0A1 224 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 NIPAL3Q6P499 406 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 THAP5Q7Z6K1 395 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TEN1Q86WV5 123 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 BAGE3Q86Y29 109 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ELMOD2Q8IZ81 293 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 OR13C9Q8NGT0 318 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GLYATL2Q8WU03 294 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TCEAL4Q96EI5 215 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CERS2Q96G23 380 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 AMDHD1Q96NU7 426 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CLCC1Q96S66 551 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 IFI27L2Q9H2X8 130 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 IL21Q9HBE4 155 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TAS2R4Q9NYW5 299 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 RCAN3Q9UKA8 241 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 FBXL3Q9UKT7 428 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SNX6Q9UNH7 406 aa-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP-2.93□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 A0A075B6Q4 140 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 A0A0B4J2C4 111 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GNAT3A8MTJ3 354 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 C2orf74A8MZ97 194 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 F8WDY8 70 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 H0YCG3 227 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 M0R1W7 72 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CXCR6O00574 342 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 AZIN1O14977 448 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFB1O75438 58 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ANXA9O76027 345 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GGPS1O95749 300 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 RBP4P02753 201 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 UCHL1P09936 223 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 PYYP10082 97 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 PTHLHP12272 177 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TM4SF1P30408 202 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ADORA1P30542 326 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM258P61165 79 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 VSNL1P62760 191 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GNAI1P63096 354 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GNA13Q14344 377 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 HADHQ16836 314 aaKnown RBP-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CLLU1Q5K131 121 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 C10orf128Q5T292 105 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 FAM104BQ5XKR9 115 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GJB7Q6PEY0 223 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 PAGE2Q7Z2X7 111 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 CMC1Q7Z7K0 106 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 FAM58AQ8N1B3 248 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 OR2T35Q8NGX2 323 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 OR2G3Q8NGZ4 309 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TESCQ96BS2 214 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ABHD14BQ96IU4 210 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 UBA5Q9GZZ9 404 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 PARVBQ9HBI1 364 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM138Q9NPI0 162 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ABRACLQ9P1F3 81 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SNX10Q9Y5X0 201 aa-2.94□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 A0A1W2PPW3 197 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 ARL5CA6NH57 179 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 H0Y3Z8 333 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 H0YJX3 145 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 TP53I11O14683 189 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 RNMTO43148 476 aaKnown RBP-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 FAM58BPP0C7Q3 252 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 IGLC6P0CF74 106 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-2.95□□□□□ -2.88
SNORD54-201ENST00000459159 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-2.95□□□□□ -2.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.8 ms